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원핵세포와 진핵세포의 차이점2025.01.061. 원핵세포 원핵세포는 단세포 생물로 약 35억년 전 지구상에 출현한 최초의 세포입니다. 원핵세포는 세포막, 세포질, 리보솜, DNA로 구성되어 있으며, 당질피질, 세포벽, 섬모, 편모, 플라스미드, 봉입, 내생포자와 같은 부속구조를 가지고 있습니다. 원핵세포는 DNA가 세포질 내 뉴클레오이드에 있고 히스톤 단백질과 결합되어 있지 않으며, 구획화가 되어 있지 않아 무작위적인 분자운동을 합니다. 원핵세포는 세포분열 시 이분법이나 단순분열을 하며, 리보솜이 진핵세포보다 약간 작고 다른 RNA와 단백질로 구성되어 있습니다. 2. 진핵세...2025.01.06
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[생화학실험] RT-PCR을 통한 간암 세포주에 대한 약물 효능 평가2025.01.291. RT-PCR RT-PCR은 역전사 반응과 PCR 반응을 이용하여 원하는 주형 mRNA의 상보적 염기쌍인 cDNA를 합성, 증폭시키는 분자생물학적 기술이다. 본 실험에서는 RT-PCR을 통해 간암 세포주 HepG2 cell에 처리한 Salsolinol이 Cyclin D1 경로에서 암세포 사멸에 유의미한 결과를 보이는지 관찰하였다. 2. Cyclin D1 Cyclin D1은 세포 주기 조절에 관여하는 단백질로, 암세포의 증식을 억제하는 역할을 한다. 본 실험에서는 Salsolinol 처리가 Cyclin D1 경로를 통해 HepG2...2025.01.29
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겔 전기영동 (agarose gel electrophoresis) 실험 리포트2025.01.141. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis은 크기에 따라 핵산(DNA 또는 RNA) 조각을 분리하는 데 사용되는 전기영동 종류이다. 음전하를 띤 DNA/RNA는 전류가 가해질 때 agarose gel의 기공을 통해 gel의 양전하 말단으로 이동하고 이때 더 작은 조각이 더 빠르게 이동한다. 결과 밴드는 자외선(UV)을 사용하여 시각화할 수 있다. 2. Taq polymerase Taq polymerase는 호열성 박테리아인 Thermus aquaticus에서 추출한 열 ...2025.01.14
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유전자 발현에서의 오페론과 되먹임 억제2025.05.111. 음성 피드백 음성 피드백은 결과가 원인을 억제하여 결과를 적절하게 유지하는 조절 작용을 말한다. 이러한 음성 피드백은 우리 몸의 모든 항상성 조절 과정과, 대부분의 호르몬 조절 과정에 관여한다. 티록신의 분비 조절이 대표적인 예시이다. 2. 되먹임 억제 유전자 발현에서도 음성 피드백과 유사한 현상인 되먹임 억제가 일어난다. 되먹임 억제는 최종 산물이 앞선 효소 반응을 억제하는 반응을 말한다. 대장균의 트립토판 합성 과정에서 트립토판이 억제자 단백질과 결합하여 오페론의 작동을 멈추게 하는 것이 대표적인 예이다. 3. 오페론 기능...2025.05.11
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[생명공학] RNA extraction, cDNA synthesis, qRT PCR2025.05.031. RNA extraction RNA를 분리하는 과정에서 가장먼저 첨가해주는 물질이 Trizol이다. Trizol은 phenol과 guanidinium thiocyanate라는 두가지 중요한 성분으로 이루어져있고 이들이 cell을 lysis하고 RNA를 안정화시키는 역할을 한다. 추가적으로 chloroform을 첨가하여 RNA와 다른 물질들을 분리한다. 2. cDNA synthesis cDNA 합성 과정에서는 reverse transcriptase 효소가 핵심적인 역할을 한다. 이 효소는 RNA를 DNA로 역전사하는 기능을 가지고...2025.05.03
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레닌저 생화학 정리노트 Ch09. DNA 기반 정보기술2025.05.101. 유전체(genome) 생물의 완전한 하나의 반수체 유전자를 의미하며, 유전체학(genomics)은 DNA에 대한 학문으로 세포와 개체 수준에서 생화학을 연구하는 학문인 system biology에 기여한다. 2. 클로닝 유전자와 그 산물에 대한 연구를 위해 동일한 복제물을 만드는 것으로, 특정 개체의 복제물(organism cloning), 특정한 유전자나 DNA 단편의 복사물(DNA cloning)을 만들 수 있다. 재조합 DNA(recombinant DNA)는 2개 이상의 소스에서 공유 결합된 조각으로 구성된 복합 DNA ...2025.05.10
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[예방약학실험8] Luciferase assay2025.05.101. Luciferase assay Luciferase assay는 NF-κB promoter와 luciferase reporter gene을 포함하는 plasmid를 HEK293 세포에 transfection하여 luciferase 발현을 통해 염증반응 조절에 중요한 유전자 발현을 확인하는 실험입니다. NF-κB는 염증반응 관련 유전자의 신호전달에 관여하는 전사인자로서 염증반응의 지표로 활용됩니다. 실험 결과, PMA는 염증을 유발하고 추출물 A는 항염증 효과가 있음을 확인할 수 있었습니다. GFP로 normalization을 하...2025.05.10
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RNA와 식물 RNA 중합효소2025.01.141. RNA의 구조적 특징 RNA는 DNA와 구조적으로 다른 점이 있는데, 리보오스 탄소 2'에 수산화기가 존재하고 티민 대신 유라실을 이용하는 등의 차이가 있다. 또한 RNA는 단백질과 같이 접힘을 통해 3차원 구조를 형성할 수 있다. 2. RNA의 종류 RNA에는 mRNA, tRNA, rRNA 등 다양한 종류가 있다. mRNA는 DNA의 유전정보를 리보솜에 전달하여 단백질 합성을 돕고, tRNA와 rRNA는 단백질 번역에 관여한다. 또한 miRNA, lncRNA 등 유전자 발현을 조절하는 비번역 RNA도 존재한다. 3. RNA ...2025.01.14
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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Bacterial Transformation 레포트2025.01.211. Transformation Transformation은 특정 DNA 조각을 생명체의 유전체 내로 삽입하여 새로운 genotype이 발현되도록 하는 방법이다. 박테리아에 plasmid를 통해 gene을 도입하는 기술로 알려져 있지만, 동물이나 식물에서도 transformation 기술이 개발되어 유전자 변형 생물(GMO)을 만드는 기술로 이용되고 있다. Bacterial plasmid는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site와 Selectable Marker로 사용하기 위한 antibioti...2025.01.21
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