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Plasmid DNA 정제2025.01.131. 대장균(E. coli) 대장균(E.coli)은 Theodor Esherich의 이름을 따서 발견되어 명명된 박테리아이다. 특징으로는 그람음성의 간균이며, 포자 생성을 하지 않으며, 1-2 microns x 30-30 micron (1 micron = 0.001 mm)크기이고, 섭씨 37도에서 쉽게 자랄 수 있다. 2. Plasmid DNA Plasmid DNA란 세균 속에 주 DNA와 별도로 존재하면서 증식할 수 있는 고리 형태의 DNA로, 원핵생물과 효모 등에서 발견된다. 대장균 세포에서 분리된 Plasmid DNA는 sup...2025.01.13
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[생화학실험] (A+) Using gel filtration to study ligand-protein interactions 예비 결과레포트2025.05.031. 효소 효소는 기질과 결합해서 효소-기질 복합체를 형성하여 화학 반응의 활성화 에너지를 낮춤으로써 물질대사의 속도를 증가시키는 생체 촉매이다. 효소는 일반적으로 단독으로 또는 더 큰 복합체로 작용하는 구상 단백질이며, 아미노산의 서열은 효소의 촉매 활성을 결정하는 구조를 지정한다. 2. gel filtration chromatography Gel filtration chromatography는 size-exclusion chromatography(SEC)라고도 부르며, 단백질의 크기에 따라 분리․정제할 수 있는 분석 기법이다. ...2025.05.03
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[만점보고서]Plasmid DNA 추출과 DNA 정량 실험보고서2025.01.171. Plasmid DNA 추출 Plasmid DNA는 세균의 세포 내에서 염색체와 별개로 존재하는 자가복제 DNA이다. Plasmid DNA 추출을 위해 Alkaline Lysis 법을 사용하여 세포를 용해시키고 plasmid DNA를 염색체 DNA와 분리한다. 이 과정에서 다양한 buffer를 사용하여 pH 변화를 조절하고 불순물을 제거한다. 2. DNA 정량 Nanodrop 분광광도계를 이용하여 추출한 plasmid DNA의 농도와 순도를 측정한다. 260nm 흡광도로 DNA 농도를 측정하고, 260nm/280nm 및 260n...2025.01.17
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밀도 이용 RNA 추출 실험 보고서2025.05.141. RNA 추출 이 보고서는 RNA 추출 실험에 대해 설명합니다. RNA는 DNA와 달리 일부 정보만을 활용하는 유전 물질로, 단백질 합성에 중요한 역할을 합니다. 실험에서는 Trizol, Chloroform, Isopropanol 등의 시약을 사용하여 RNA를 추출하고 정제하는 과정을 자세히 설명하고 있습니다. 또한 RNA 추출 과정에서 사용되는 시약들의 특성과 작용 원리, RNA 안정성 유지를 위한 DEPC 처리 등에 대해서도 자세히 다루고 있습니다. 2. RNA 구조와 종류 보고서에서는 RNA의 다양한 종류와 구조에 대해 설...2025.05.14
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전기영동 결과보고서2025.01.121. 전기영동 전기영동은 DNA, RNA, 단백질 등의 생물학적 거대분자를 분리하는 데 사용되는 기술입니다. 이번 실험에서는 Agarose gel을 사용하여 PCR 증폭 산물을 전기영동으로 분리하였습니다. 전기영동 과정에서 주의해야 할 점으로는 TAE 완충액의 적절한 양 유지, 전기영동 시간 관리, 시료 주입 시 gel 판 손상 방지 등이 있습니다. 또한 Polyacrylamide gel을 사용하는 실험도 있으며, 이는 단백질 분리나 작은 크기의 DNA 분리에 주로 사용됩니다. 2. PCR PCR(Polymerase Chain Re...2025.01.12
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SDS-PAGE 이론2025.05.071. SDS-PAGE SDS-PAGE는 Sodium Dodecyl Sulfate- Polyacrylamide gel electrophoresis의 약자이다. SDS는 음이온성 계면활성제의 일종으로 단백질의 가용화제로서 이용되고 있으며 단백질의 전기영동에서 SDS-PAGE법이 가장 일반적인 방법으로 이용된다. SDS-PAGE의 원리는, 단백질을 구성하는 아미노산에 의해서 +,- 상관없이 어느쪽이건 전하를 띄지만 SDS가 결합함으로써 일시적으로 단백질이(-)하전을 띄어 모든 분자를 양극으로 이동시키고, gel의 pore 사이즈에 의해서...2025.05.07
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식품생화학-아미노산, 질소, 핵산, DNA 복제 등2025.05.071. 아미노산 및 질소대사 단백질은 생체분자를 합성하고 남은 아미노산이 그대로 저장되지 않고 분해되어 에너지원으로 이용되거나 글리코겐, 지방 등으로 저장된다. 아미노산의 α-아미노기는 요소로 전환되어 제거되며, 아미노산의 탄소골격은 아세틸CoA, 피루브산 또는 구연산회로의 중간대사물로 전환된다. 질소는 생물에서 매우 중요한 역할을 하지만 생물학적으로 유용한 질소는 충분하지 않으며, 일부 질소고정 미생물이 질소기체를 암모니아로 환원한다. 아미노산은 단백질의 구성요소이자 신경전달물질, 글루타티온, 뉴클레오티드 및 헴의 전구물질로 중요하...2025.05.07
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추위 노출에 따른 백색지방의 베이지화와 갈색지방 활성화 연구2025.11.181. qPCR을 이용한 유전자 발현 측정 qPCR(실시간 정량적 중합효소연쇄반응)은 RNA를 역전사효소로 cDNA로 변환한 후 실시간으로 증폭하는 기법입니다. 본 실험에서는 추위 노출 마우스와 일반 환경 마우스의 지방조직에서 Ucp1, Dio2, Tbp 유전자의 mRNA 발현량을 비교 측정했습니다. RT-PCR 단계에서 total RNA와 oligo dT, dNTP를 반응시킨 후 역전사효소, DTT와 혼합하여 cDNA를 생성하고, 이를 qPCR로 40 사이클 증폭하여 유전자 발현 수준을 정량화했습니다. 2. 백색지방의 베이지화와 갈...2025.11.18
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미니프렙을 통한 플라스미드 DNA 분리 및 정량2025.11.161. 미니프렙(Minipreparation) 방법 E. coli에 형질전환된 플라스미드를 미니프렙 방법으로 분리하는 실험이다. Solution I(glucose, Tris-Cl, EDTA)에서 세포 용해 준비, Solution II(SDS, NaOH)에서 세포 용해 및 DNA 변성, Solution III(potassium acetate, glacial acetic acid)에서 중화 과정을 거친다. 최종 DNA 농도는 0.2322 µg/µl이었다. 효율 향상을 위해 bacterial pellet 제거, inverting으로 혼합,...2025.11.16
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구강상피로부터 DNA 추출 실험 보고서2025.05.141. DNA 추출 과정 DNA 추출 과정에서 사용되는 다양한 용액들의 역할에 대해 자세히 설명하고 있습니다. PBS 용액은 세포의 삼투압 변화를 방지하고, GL-buffer는 계면활성제를 포함하여 세포막을 파괴하는 역할을 합니다. Proteinase K와 RNase A는 각각 단백질과 RNA를 분해하여 DNA를 정제하는데 사용됩니다. 이후 Spin column을 이용한 정제 과정에서는 Chaotropic agent와 고농도 염이 DNA를 실리카 막에 흡착시키는 역할을 합니다. 2. PCR 실험 설계 PCR 실험에서 실험군과 대조군을...2025.05.14
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