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박테리아 세포로부터 플라스미드 정제2025.11.131. 플라스미드 정제 박테리아 세포로부터 플라스미드를 분리하고 정제하는 과정으로, 세포 용해, 단백질 제거, DNA 침전 등의 단계를 포함합니다. 플라스미드는 박테리아에서 자연적으로 발견되는 작은 원형 DNA 분자로, 유전자 공학 및 생명공학 연구에 광범위하게 사용됩니다. 2. 박테리아 세포 배양 플라스미드 정제를 위한 전제 조건으로, 플라스미드를 함유한 박테리아 세포를 배양하여 충분한 양의 세포를 확보하는 과정입니다. 일반적으로 LB 배지에서 배양되며, 항생제 선택 마커를 사용하여 플라스미드 보유 세포만을 선별합니다. 3. DNA...2025.11.13
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박테리아에서 DNA 분리2025.01.271. plasmid DNA 분리 실험 목적은 plasmid DNA 분리에 대해 이해하고, 그 과정 중 하나인 plasmid mini-preparation에 대해 알아보는 것이다. plasmid DNA 분리법의 공통적인 세 단계는 overnight culture, mini preparation, 순수한 plasmid DNA 분리 과정이다. mini-prep은 plasmid DNA를 소량 분리하는 방법으로, 알칼리 조건에서 세포를 파괴시켜 DNA만을 분리하는 것이다. 2. plasmid DNA 분리 시약 실험에 사용된 시약은 LB 배지...2025.01.27
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생물공정실험 예비보고서_RNA Extraction and Quantification2025.01.071. 유전자 발현과 조절 유전자 발현 경로는 전사와 번역으로 나뉘며, 전사 개시, 전사 후 가공, 번역 단계에서 조절될 수 있다. 전사 활성은 크로마틴 구조 변화, 전사인자 결합 등으로 조절되며, 전사 후에는 mRNA 가공, 번역에서는 mRNA 사용 속도 조절 등으로 이루어진다. 2. TRIzol을 이용한 RNA 추출 TRIzol 시약은 페놀-구아니딘 이소티오시아네이트로 구성되어 세포막을 파괴하고 RNase를 억제하여 RNA를 선택적으로 추출할 수 있다. 세포 용해액을 원심분리하면 RNA가 수용층에 존재하게 되며, 이후 isopro...2025.01.07
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인천대학교 나노바이오실험(1) Genomic DNA prep & Gel Electrophoresis2025.01.141. Genomic DNA Genomic DNA는 염색체 DNA로, Plasmid DNA와 같은 Extra-chromosomal DNA와 대조되는 개념이다. 대부분의 생물은 모든 세포에서 같은 Genomic DNA를 갖지만, 특정 gene의 발현으로 cell type과 function이 달라진다. 어떤 organism의 genomic DNA인지에 따라 바이러스, 박테리아, 진핵생물 등의 특성을 지닌다. 2. DNA 추출 방법 DNA 추출은 Lysis, Precipitation, Purification 3단계로 이루어진다. Lysis...2025.01.14
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플라스미드 DNA의 분리 및 정제 방법2025.01.041. 플라스미드 DNA 분리 플라스미드 DNA는 세균 세포에서 분리할 수 있으며, 일반적인 total cell DNA 분리 방법과 유사하다. 세포를 배양하여 수확하고 세포 추출물을 만든 후, 단백질을 제거하고 에탄올 침전으로 DNA를 농축할 수 있다. 그러나 플라스미드 DNA 분리에는 세균 염색체 DNA와의 분리가 중요한 차이점이다. 플라스미드는 세균 염색체에 비해 크기가 작고 구조적 차이가 있어 이를 이용하여 분리할 수 있다. 2. 플라스미드 미니프레프 방법 플라스미드 DNA를 소량으로 분리하는 대표적인 방법으로는 알칼리 용해법,...2025.01.04
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플라스미드 DNA 정제 실험 예비레포트2025.11.171. 플라스미드 DNA 정제 박테리아 세포로부터 플라스미드 DNA를 정제하는 것은 유전자 재조합 실험의 기본 과정이다. 플라스미드 DNA는 세균의 유전체 DNA에 비해 매우 작고, 유전체 DNA는 선형이 되는 반면 플라스미드 DNA는 원형의 CCC(공유결합 닫힌 원형) 구조를 가진다는 차이점을 이용하여 정제한다. 1979년 번보임과 돌리 등이 개발한 알칼리 세포용해법이 현재 널리 사용되고 있다. 2. 알칼리 세포용해법 알칼리 세포용해법은 3단계로 구분된다. 첫째, 대장균 세포를 완충액에서 안정화시킨다. 둘째, 알칼리와 SDS 용액을...2025.11.17
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TECAN을 이용한 DNA quality check와 전기영동을 통한 대장균의 병원성 유형 확인2025.01.121. DNA 추출 및 정제 세포로부터 DNA를 분리하기 위해서는 먼저 세포 내 DNA가 세포 밖으로 유출될 수 있도록 세포벽 및 세포막을 분해시켜야 한다. DNA 추출은 크게 세 단계로 이루어지며, sample의 세포막을 제거하는 단계인 Lysis, DNA 구조를 제외한 불순물을 제거하는 단계인 Washing, 불순물이 필터링된 DNA 샘플만을 tube에서 용출해내는 단계인 Elution이 있다. 2. DNA quality check 추출한 DNA는 DNA quality check를 해주고, Nucleic acid quantific...2025.01.12
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박테리아에서 DNA 분리 (생화학 실험)2025.01.161. Alkaline lysis mini prep Alkaline lysis mini prep은 박테리아로부터 플라스미드 DNA를 분리하는 가장 보편적인 방법이다. 이 방법은 세포벽과 세포막을 부수고 DNA만을 분리해낸 후, 크로모좀 DNA와 플라스미드 DNA를 구분하여 순수한 플라스미드 DNA만을 회수하는 것이 핵심이다. 알칼리 조건에서 크로모좀 DNA는 변성되어 침전되지만, 플라스미드 DNA는 supercoiled 상태를 유지하여 회수할 수 있다. 2. 플라스미드 DNA 분리 과정 플라스미드 DNA 분리 과정은 크게 3단계로 이...2025.01.16
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RNA 추출, cDNA 합성 및 qRT-PCR2025.01.181. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA의 상보적 가닥에 결합하는 2개의 프라이머를 동시에 사용하여 증폭을 원하는 DNA의 특정 영역만을 in vitro에서 복제, 증폭하는 기술이다. 3단계를 거쳐 DNA를 복제하는데, 변성, 결합, 신장 과정을 반복하여 DNA를 증폭시킨다. 2. RT-PCR (Reverse Transcriptase PCR) RT-PCR은 유전자에서 만들어진 RNA에서 역전사효소를 이용하여 cDNA를 생성한 후, cDNA를 주형 가닥으로 PCR을 수행하여, 유전자의 RNA 발현...2025.01.18
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박테리아 세포로부터 플라스미드 정제 결과2025.11.131. 플라스미드 정제 박테리아 세포로부터 플라스미드를 분리하고 정제하는 과정입니다. 플라스미드는 박테리아에서 염색체 외에 존재하는 작은 원형 DNA 분자로, 유전자 공학 및 생명공학 연구에서 중요한 도구로 사용됩니다. 정제 과정에는 세포 용해, 단백질 제거, DNA 추출 및 정제 단계가 포함되며, 최종적으로 순수한 플라스미드 DNA를 얻을 수 있습니다. 2. 박테리아 세포 배양 플라스미드 정제를 위해 박테리아 세포를 배양하는 단계입니다. 박테리아는 플라스미드를 포함하고 있으며, 충분한 양의 플라스미드를 얻기 위해 적절한 배양 조건에...2025.11.13
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