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Plasmid DNA 분리 결과 레포트2025.04.261. Plasmid DNA 분리 이 실험에서는 박테리아에서 Plasmid DNA를 분리하는 과정을 수행했습니다. 박테리아 배양액에서 박테리아를 추출하고, mini prep 방법을 통해 세포벽과 세포막을 부수어 Plasmid DNA만 분리했습니다. 그 후 1% Agarose Gel에 Sample Loading하고 전기영동을 통해 DNA 밴드를 확인했습니다. 하지만 실험 결과 DNA가 추출되지 않아 DNA Ladder와 비교할 수 없었습니다. 이는 실험 과정에서 약간의 차이로 인해 오차가 발생했거나 실험 진행이 미숙했기 때문으로 분석됩...2025.04.26
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SDS-PAGE를 이용한 단백질의 분석2025.01.231. SDS-PAGE SDS-PAGE는 SDS가 단백질에 일정 간격으로 결합하여 charge density를 일정하게 하고, 단백질을 변형시켜 모든 단백질이 일정 모양(선형)을 갖게 함으로써 단백질이 전기장에서 크기(분자량)에만 의존적으로 분리되게 한다. Stacking gel과 Resolving gel의 pH 차이로 인해 단백질이 크기별로 분리된다. Coomassie blue 염색을 통해 단백질 band를 확인할 수 있다. 2. 단백질 정제 실험 결과, sample2에서 Naa30 protein의 사이즈에 해당하는 protein ...2025.01.23
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생물의 분류-분자계통분류 실험 보고서2025.05.141. 생물의 분류 이번 실험에서는 5s ribosomal mRNA nucleotide sequence를 사용하여 계통수를 그렸다. 5S rRNA는 120nt 정도의 작은 RNA 분자이고 생물학적 기능에 대해 다양한 연구가 진행되어 오고 있다. 5S rRNA는 Escherichia coli ribosomes의 large subunit의 한 부분이다. Prokaryotes와 organelles에서는 5S rRNA는 하나의 긴 transcript의 한 부분으로 형성되어 maturation 과정에서 16S, 23S, 5S로 나뉘어지며 Eu...2025.05.14
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DNA - EtBr 염색, Methylene blue 염색2025.05.111. DNA 구조 DNA는 이중나선 구조로 구성되어 있으며, 두 가닥의 DNA가 거의 공통된 축의 주위를 오른쪽으로 감고 있다. 이 구조는 DNA에 있는 화학 결합이 비틀림을 만들어내며, 그 결과 안정성을 가지게 해준다. 또한 이중나선 구조 안쪽에 있는 염기를 보호하기에 적절하다. 최근에는 다양한 유전자 치료법에서 잘못된 염기서열을 교정할 때 두 가닥의 상보성을 활용하기도 한다. 2. DNA 염색 방법 DNA 염색 방법에는 EtBr(Ethidium bromide)과 Methylene blue 염색 방법이 있다. EtBr은 DNA의 ...2025.05.11
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제한효소를 이용한 플라스미드 DNA 분석 및 전기영동2025.11.121. 제한효소(Restriction Enzyme) 제한효소는 DNA의 특정한 부위를 인식하여 phosphodiester bond를 절단하는 효소이다. 본 실험에서 사용된 HindIII 효소는 DNA상에서 T와 C 사이의 결합을 끊어 원형의 플라스미드 DNA를 선형 형태로 변환한다. 제한효소의 특이성에 따라 DNA의 특정 사이트를 찾아 절단하며, 이를 통해 제한효소 지도를 작성할 수 있다. 2. 아가로스 겔 전기영동(Agarose Gel Electrophoresis) DNA 조각을 분리하고 인식하는 가장 일반적인 방법으로, 간단하고 ...2025.11.12
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플라스미드 DNA 준비 및 제한효소 지도 작성2025.11.121. 플라스미드 DNA 준비 플라스미드는 박테리아 세포에서 발견되는 작은 원형 DNA 분자로, 유전자 공학 실험에서 중요한 벡터로 사용됩니다. 플라스미드 DNA 준비 과정은 박테리아 배양, 세포 용해, DNA 추출 및 정제 단계를 포함하며, 순수한 플라스미드 DNA를 얻기 위해 여러 정제 기법이 적용됩니다. 이 과정을 통해 얻은 플라스미드는 분자생물학 연구와 유전자 클로닝에 필수적인 재료입니다. 2. 제한효소 지도 작성 제한효소 지도(Restriction map)는 DNA 분자 위에서 특정 제한효소의 인식 부위와 절단 위치를 나타내...2025.11.12
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SDS PAGE 실험보고서2025.05.041. SDS PAGE SDS PAGE란 Sodium Dodecyl Sulphate -Polyacrylamide Gel Electrophoresis의 줄임말로써, PAGE는 전기영동법을 지칭하는 말로서 사용되기도 하고, 때로는 겔 자체를 지칭하기도 한다. 이를 사용한 전기 영동법 역시 기본적 원리는 한천을 이용한 것과 같다. 허나 폴리아크릴아마이드 겔은 한천 겔에 비해 훨씬 촘촘한 다공성 물질이기 때문에 한천을 이용할 때에 비해 분자량이 작고 크기 차이가 작은 시료들을 분리할 때 이용한다. 따라서 또다른 고분자 물질이지만 핵산에 비해...2025.05.04
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광학이성질체와 카이랄성2025.01.141. 거울상 이성질체 거울상(mirror-image) 이성질체는 광학활성(Optical activity)이 있어 광학 이성질체라고도 한다. 거울상 이성질체는 거울에 비춘 상처럼 좌우만 뒤바뀌었을 뿐 왼손과 오른손의 관계와 같이 완전히 겹쳐지지 않는 입체이성질체를 말한다. 대부분의 거울상 이성질체는 녹는점, 끓는점, 이온화 상수와 산,염기 반응과 같이 물리화학적 성질은 같지만 편광된 빛을 흡수하는 정도가 달라서 광학활성을 갖는다. 2. 광학이성질체 에스케타민 케타민(ketamine)은 거울상관계를 가진 분자구조인 50%의 에스케타민(...2025.01.14
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[환경공학실험] PCR 및 전기영동법2025.01.131. PCR (중합효소 연쇄반응) PCR은 유전자를 증폭하는 방법으로, 이미 알고 있는 일부의 염기서열 중 특정 DNA 부위를 반복 합성하여 원하는 DNA 분자를 증폭시키는 방법이다. PCR은 보통 25 ~ 35 cycle로 실시하며, 이를 통해 특정 부위의 DNA를 수시간 내에 어마어마하게 증폭할 수 있다. 증폭된 DNA는 다양한 실험에 이용될 수 있고, 의학연구에 응용할 수 있다. 2. 전기영동법 전기영동법은 주로 생체 고분자들의 성질을 연구하고, 그것들을 분석, 분리, 정제하는 중요한 방법 중 하나이다. DNA, RNA, 단백...2025.01.13
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DNA 겔 전기영동 실험 보고서2025.11.121. DNA 겔 전기영동 DNA 겔 전기영동은 DNA 분자를 전기장을 이용하여 아가로스 겔을 통해 분리하는 생명과학 실험 기법입니다. 음전하를 띤 DNA는 양극으로 이동하며, 분자의 크기에 따라 이동 속도가 달라져 다양한 크기의 DNA 단편을 분리할 수 있습니다. 이 기법은 유전자 분석, DNA 지문 감식, PCR 산물 확인 등 다양한 분야에서 활용됩니다. 2. 아가로스 겔 아가로스는 해조류에서 추출한 다당류로, 겔 전기영동에서 매질로 사용됩니다. 아가로스 농도에 따라 겔의 기공 크기가 결정되며, 이는 분리되는 DNA의 크기 범위를...2025.11.12
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