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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석)2025.01.231. Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석 본 실험에서는 구강 상피세포를 채취하여 PCR로 증폭시키고 PAGE를 이용하여 밴드의 발현양상을 통해 STR을 분석하였다. 인간의 유전자 sequence는 거의 유사하지만 genome상의 simple sequence가 나타나는 부위와 그 크기는 차이가 있다. Simple sequence에서 반복되는 숫자는 allele에 따라 다른데 이 부분을 DNA 비교분석으로 allelic variation을 조사하는 것이다. 밴드의 발현양상을 STR을 분석가능한데 인간의 경우에...2025.01.23
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Genome editing / knockout 벡터 확립 및 도입2025.05.031. Genome Editing Genome Editing은 생명체의 특정 염기서열을 교정하거나 편집하는 기술을 의미한다. 이러한 Genome editing 기술에는 과거부터 이용되었던 Zinc finger nucleases나 TALEN을 이용하는 방법이 있었으나 현재는 높은 정확도와 효율성을 갖추고, 비교적 쉽게 디자인할 수 있는 기술인 CRISPR을 주된 tool로써 사용하고 있다. CRISPR/Cas9 기술은 효소가 절단하는 부분의 염기서열을 guide RNA(gRNA)로서 인위적으로 제공해주어 원하는 부분의 DNA를 절단하도...2025.05.03
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NGS 분석 기기의 기술혁신전략: Illumina 사례 분석2025.11.131. Next Generation Sequencing (NGS) 기술 NGS는 적은 양의 샘플로 저비용으로 개인의 유전정보를 분석할 수 있는 차세대 염기서열 분석 기술입니다. DNA library와 cloning 과정을 제거하는 clonal amplification, 수십만 개의 clone을 동시에 이용하는 massively parallel, 모세관 전기영동을 제거한 base/color calling 등 3가지 개선 기술이 도입되었습니다. 이를 통해 인간의 genome 서열을 하루도 채 걸리지 않는 시간에 분석할 수 있게 되었으며,...2025.11.13
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Realtime PCR을 이용한 유전자 발현 분석)2025.01.231. RNA sequencing RNA sequencing은 DNA로부터 전사되는 모든 RNA 전사체의 염기서열을 차세대 분석기술을 사용하여 분석하는 기술이다. RNA sequencing을 위해서는 cDNA가 필요한데 cDNA를 준비하는 일반적 과정은 보통 RNA 추출>RNA 선택>cDNA 합성>라이브러리 제작으로 이루어진다. RNA 염기서열 분석 기술을 통해 alternative RNA splicing, 유전자의 발현량, 염기서열의 변이, gene fusion, single nucleotide polymorphism, SNP 등의...2025.01.23
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생물정보학을 활용한 유전자 서열 분석2025.01.041. 생물정보학 생물정보학은 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받아 생물학적 데이터를 이용하여 유전자를 해석하고 기능을 유추해내는 작업을 하는 학문입니다. NCBI는 생물학의 구글이라고 볼 수 있는 국립 생물 공학 정보센터로, 온라인으로 유전자나 단백질 서열을 검색할 수 있습니다. BLAST는 연구 과정에서 얻은 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열을 데이터베이스와 비교하는 알고리즘입니다. BLOSUM은 단백질 간 서열의 유사성을 확인할 때 사용하는 도구로, 아미노산 간 치환 확률을 나타내는 행렬입니다. 이를 통해...2025.01.04
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CRISPR를 이용한 만성골수성백혈병 유전자 전위의 복구2025.01.281. 만성골수성백혈병 만성 골수성 백혈병은 필라델피아 염색체를 지닌 조혈모 세포의 클론이 비정상적으로 확장되면서 골수 내에 비정상 세포가 과도하게 증식하여 생기는 질환입니다. CML의 원인은 9번 염색체와 22번 염색체의 각각에서 일정 부분이 절단된 후에 두 조각이 서로 위치를 바꾸어 이동하는 전위에 의해서 생긴 필라델피아 염색체에 의해서 발병합니다. 이 전위로 인해서 9번 염색체의 ABL 유전자와 22번 염색체의 BCR 유전자의 융합이 일어나게 되고, BCR-ABL 융합 유전자로 인해 비정상적인 타이로신 카이네이즈의 활성을 가지는...2025.01.28
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DNA cloning 방법/enzyme, transformation, selection mark/생화학 보고서2025.01.201. DNA cloning 방법 DNA cloning은 타깃 유전자를 박테리아의 게놈에서 잘라내어 plasmid에 삽입하는 과정입니다. 이 과정에서 restriction enzyme을 사용하여 유전자를 자르고, ligase를 사용하여 유전자를 plasmid에 붙입니다. 이렇게 만들어진 recombinant vector는 박테리아에 형질전환되어 증폭됩니다. 형질전환 과정에서는 열처리를 통해 세포막을 열어 plasmid가 들어가게 하며, 항생제 내성 유전자를 선별 마커로 사용하여 형질전환된 세포를 선별합니다. 2. Enzyme 사용 D...2025.01.20
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진화와 발생: 원생생물, 척추동물 해부 및 계통수 분석2025.11.171. 원생생물의 특징과 관찰 짚신벌레, 유글레나, 해캄 등의 원생생물을 광학현미경으로 관찰하여 그 형태적 특징을 파악했다. 유글레나는 편모를, 짚신벌레는 섬모와 수축포를 가지며, 해캄은 다량의 나선 구조를 보였다. 원생생물은 단세포 진핵생물로서 다양한 운동과 영양 활동을 수행하며, 각 종마다 특정 배율에서 최적으로 관찰된다. 2. 척추동물의 해부학적 구조 수컷 검정 쥐를 모델동물로 사용하여 복강, 흉강, 뇌를 순서대로 해부했다. 횡격막을 기준으로 복강과 흉강으로 나뉘며, 복강에는 간, 신장, 위, 장관 등이, 흉강에는 심장, 폐, ...2025.11.17
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제한효소를 이용한 플라스미드 DNA 분석 및 전기영동2025.11.121. 제한효소(Restriction Enzyme) 제한효소는 DNA의 특정한 부위를 인식하여 phosphodiester bond를 절단하는 효소이다. 본 실험에서 사용된 HindIII 효소는 DNA상에서 T와 C 사이의 결합을 끊어 원형의 플라스미드 DNA를 선형 형태로 변환한다. 제한효소의 특이성에 따라 DNA의 특정 사이트를 찾아 절단하며, 이를 통해 제한효소 지도를 작성할 수 있다. 2. 아가로스 겔 전기영동(Agarose Gel Electrophoresis) DNA 조각을 분리하고 인식하는 가장 일반적인 방법으로, 간단하고 ...2025.11.12
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PCR과 아가로스 겔 전기영동 실험2025.11.171. PCR (중합효소 연쇄반응) PCR은 DNA 중합효소를 이용해 시험관 내에서 DNA 상의 특정 염기서열을 빠르게 증폭하는 기술입니다. 극히 소량의 DNA만으로도 증폭이 가능하며, denaturation, annealing, extension의 3단계가 1 cycle을 구성합니다. 이 실험에서는 35 cycle이 진행되어 이론상 2^35개의 DNA가 생성됩니다. Pre-denaturation 단계에서 template DNA를 단일가닥으로 분리하고, denaturation에서 이중가닥 DNA의 수소결합을 파괴합니다. Anneali...2025.11.17
