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레닌저 생화학 정리노트 Ch04. 단백질의 3차원 구조2025.05.101. 단백질의 3차원 구조 단백질의 3차원 구조는 주로 약한 상호작용에 의해 안정화되며, 4단계로 구성됩니다. 1단계는 아미노산이 공유적으로 연결되는 것이고, 2단계는 3차원 배열인 a 나선과 b 시트 형태입니다. 3단계는 단백질 사슬과 보결분자단을 포함한 모든 원자의 3차원 배열이며, 4단계는 subunits의 배열입니다. 단백질의 3차원 구조는 specific biological function을 결정하며, 이를 native fold라고 합니다. 단백질에서 다수의 호의적인 상호작용, 즉 소수성 효과, 수소 결합, London d...2025.05.10
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서강대학교 일반생물학실험1 실험 6. GFP 단백질과 단백질 정량 (Protein Measurements)2025.01.021. 단백질 정량 방법 실험에서는 Lowry assay와 Extinction coefficient assay 두 가지 단백질 정량 방법을 사용하여 EGFP의 질량농도를 측정하였다. Lowry assay는 Biuret reaction과 Folin reaction을 거쳐 750nm에서 흡광도를 측정하고 BSA 표준곡선을 이용하여 EGFP 농도를 계산하였다. Extinction coefficient assay는 EGFP의 몰흡광계수와 Lambert-Beer's Law를 이용하여 488nm에서 EGFP 농도를 직접 계산하였다. 두 방법의 ...2025.01.02
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단백질 정량 분석: BCA assay2025.01.021. 단백질 정량 분석 BCA assay는 단백질 정량 분석 방법 중 하나로, 단백질 시료에 BCA 시약을 가한 후 흡광도를 측정하여 단백질 농도를 구하는 방법이다. 이 방법은 단백질에 의해 환원된 구리 이온이 BCA와 반응하여 보라색 화합물을 형성하는 원리를 이용한다. 표준 단백질로 BSA를 사용하여 표준곡선을 그린 후, 미지의 단백질 시료의 흡광도를 대입하여 농도를 계산할 수 있다. BCA assay는 단백질의 아미노산 조성에 크게 영향을 받지 않아 비교적 정확한 정량이 가능하다는 장점이 있다. 1. 단백질 정량 분석 단백질 정...2025.01.02
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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SDS-PAGE를 통한 단백질 분리 실험2025.01.031. SDS-PAGE SDS-PAGE는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 기법으로, 단백질을 SDS로 변성시켜 모든 단백질이 유사한 전하/분자량 비를 가지도록 만든 후 전기영동을 통해 분리한다. 이 실험에서는 SDS-PAGE의 원리와 사용되는 시약들의 특성을 이해하고, 실제로 단백질 분리 실험을 진행하여 결과를 분석하였다. 2. 단백질 변성 SDS는 단백질의 3차원 구조를 풀어 선형 구조로 만들어 주며, 단백질에 음전하를 부여한다. 이를 통해 단백질의 고유 전하와 상관없이 분자량에 따라 분리할 수 있게 된다. 실험에서는 단백질 시료를...2025.01.03
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단백질 정량2025.05.071. Biuret method 단백질의 알칼리성 수용액에 저농도 황산구리용액을 몇 방울 떨어뜨리면 청자~적자 색을 띠는 단백질 발색반응이 일어난다. 발색은 구리(II)이온과 착체가 형성되어 이루어진다. 트리펩티드 이상의 펩티드도 같은 반응을 보이고, 발색률은 펩티드에 따른 차이가 거의 없다. 조작이 간단하고 다수의 시료를 단시간에서 측정할 수 있어 많이 사용하지만, 감도가 낮다. 2. Ultraviolet Absorption Method 단백질의 tryptophan과 tyrosin잔기가 280 nm에서 강하게 흡광하는 성질을 이용하...2025.05.07
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단백질 분석(SDS-PAGE & Fluorescence)2025.05.141. SDS-PAGE SDS-PAGE는 Sodium dodecyl sulfate - polyacrylamide gel eletrophoresis의 약자로, 5~250 kDa 사이의 단백질을 분리할 때 사용되는 방법입니다. SDS는 단백질에 결합하여 전하의 영향을 배제하고 크기에 의해 이동속도가 결정되도록 합니다. 또한 DTT와 같은 reducing agent는 단백질의 disulfide bond를 변성시켜 linear한 1차 구조로 만듭니다. SDS-PAGE 후 단백질을 확인하기 위해 Coomassie Briliant Blue, s...2025.05.14
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단백질의 검출 과제 레포트2025.05.111. 단백질의 구조 단백질은 C, H, O, N, S를 주성분으로 구성된 화합물이며, 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 사슬로 이루어져 있다. 단백질은 1차, 2차, 3차, 4차 구조로 이루어져 있으며, 이러한 구조에 따라 단백질의 기능이 결정된다. 2. 단백질의 기능 단백질은 효소, 구조, 수송, 저장, 신호, 수용체, 조절단백질 등 다양한 기능을 가지고 있다. 단백질은 세포 내외의 지지, 운동 조절, 신호 전달 등 다양한 역할을 수행한다. 3. 단백질의 변성 단백질의 기능은 단백질의 구조에 의존하므로, 높은 온도, 과도한 염분...2025.05.11
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단백질의 검출2025.01.271. 단백질의 기능과 구조 이번 실험에서는 단백질의 기능과 구조를 이해하고, 단백질의 정성 분석법에 대해 배웠습니다. 실험을 통해 단백질의 존재 유무를 확인하였고, 뷰렛 반응과 Bradford Assay 반응의 특성을 비교하였습니다. 뷰렛 반응은 색 변화가 미미하여 관찰하기 어려웠지만, Bradford Assay 반응은 빠르고 민감도가 높아 확실한 색 변화를 관찰할 수 있었습니다. 이를 통해 단백질 검출 실험에서 Bradford Assay 반응이 더 효과적임을 알 수 있었습니다. 2. 단백질의 정성 분석법 이번 실험에서는 단백질의 ...2025.01.27
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단백질의 정량분석2025.05.051. 단백질 정량 분석 이 실험에서는 Lowry method와 Bradford method를 사용하여 단백질의 농도를 측정하였습니다. Lowry method는 단백질의 아마이드결합에 의한 구리이온의 환원을 토대로 측정하는 방식이며, Bradford method는 Coomassie Brilliant Blue 염색약이 단백질과 결합하여 색이 변하는 것을 이용하는 방식입니다. 실험 결과, 각 미지시료의 단백질 농도가 다르게 나온 것으로 보아 시료 간 단백질 함량의 차이가 있음을 알 수 있었습니다. 1. 단백질 정량 분석 단백질 정량 분석...2025.05.05
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