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PAGE를 이용한 단백질의 검정2025.05.131. 단백질의 구조와 기능 단백질은 아미노산이라는 작은 구성인자의 중합체이며, 1차 구조, 2차 구조, 3차 구조, 4차 구조로 이루어져 있다. 단백질은 효소, 호르몬, 항체, 수송 단백질, 수용체 단백질, 운동 단백질, 구조 단백질 등 다양한 기능을 수행한다. 단백질은 pH, 염의 농도, 온도 등의 변화에 의해 변성될 수 있다. 2. 전기영동을 이용한 단백질 분리 전기영동은 전기적 힘을 이용하여 단백질과 같은 큰 분자들을 gel에서 이동시켜 크기에 따라 분리하는 기술이다. SDS-PAGE는 SDS와 polyacrylamide를 이...2025.05.13
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제한효소를 이용한 DNA 절단 및 전기영동 분석2025.11.171. 제한효소(Restriction Enzyme) 제한효소는 주로 세균이 보유한 DNA 절단 효소로, 외부 바이러스의 DNA를 절단하여 자기 보호 기능을 한다. 종류에 따라 4개 또는 6개의 염기서열을 인식하여 비점착성 또는 점착성 말단을 생성한다. 같은 효소로 절단된 부위는 동일한 끝을 가지므로, 표적DNA와 플라스미드를 같은 제한효소로 자르고 ligase로 결합시켜 재조합 DNA를 만들 수 있다. DNA 클로닝 등 분자생물학 연구에 광범위하게 사용된다. 2. 전기영동(Electrophoresis) 전기장의 영향으로 전하를 띤 물...2025.11.17
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Gel extraction 예비레포트 결과레포트2025.05.161. Gel Extraction 이번 실험의 목적은 전기영동한 Gel로부터 원하는 DNA를 추출하기 위해 Gel Purification Kit을 이용하여 DNA를 정제하는 것이었다. 실험 결과 DNA 농도가 예상보다 낮게 나왔는데, 이는 버퍼로 계속 씻어주어 DNA 양이 줄어들었거나, 원심분리가 제대로 되지 않아 원하는 DNA가 하층액에 섞여 버려졌을 가능성, 또는 DNA가 단백질이나 페놀로 오염되었을 가능성 때문인 것으로 보인다. 이를 해결하기 위해서는 원심분리 시간을 늘리거나, 이소프로판올을 추가로 넣어 DNA를 더 잘 침전시키...2025.05.16
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식품생화학 아미노산, 펩타이드, 단백질 요약2025.05.071. 아미노산과 펩타이드 아미노산은 단백질을 이루는 기본단위 물질로서, 20개 다른 종류의 아미노산이 결합하여 펩타이드를 이루고 단백질을 형성합니다. 아미노산은 극성 아미노산(중성, 산성, 염기성)과 비극성 아미노산으로 구분되며, 중성 pH 상태에서 양극성 이온 형태로 존재합니다. 펩타이드는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 구조이며, 일부 펩타이드는 고유의 생리활성을 가지고 있습니다. 대표적인 합성 펩타이드인 아스파탐은 감미료로 사용되고 있습니다. 2. 단백질 구조 단백질은 아미노산이 중합된 고분자 물질로, 1차 구조(아미노산 ...2025.05.07
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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단백질의 분석(질량, 서열, ELISA) 요약정리2025.04.301. 단백질 질량 측정 단백질의 질량을 측정하기 위해서는 단백질을 기체 상태의 이온으로 바꾼 후 전기장 하에서 질량 대 전하비(m/z)를 구하는 방식을 사용한다. MALDI와 ESI 기법을 통해 단백질을 이온화할 수 있으며, 이후 TOF 분석기를 이용하여 질량을 측정할 수 있다. 2. 항체를 이용한 단백질 검출 및 정량 항체는 특정 단백질에 결합하여 면역 반응을 일으키므로, 이를 이용하여 단백질을 검출하고 정량할 수 있다. ELISA 기법은 항체와 연결된 효소를 이용하여 단백질의 존재 유무와 양을 측정할 수 있다. Western b...2025.04.30
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생명과학실험1 단백질 정제 및 기능 분석을 위한 DEAE sepharose anion exchange chromatography2025.01.171. 단백질 정제 이 실험에서는 E.coli에서 추출한 alkaline phosphatase(AP) 단백질을 DEAE sepharose anion exchange chromatography를 이용하여 정제하는 과정을 다루고 있습니다. AP는 E.coli의 outer membrane과 inner membrane 사이에 존재하는 periplasmic space에 위치하며, osmotic shock을 통해 추출할 수 있습니다. 추출된 AP 단백질 혼합물은 열처리, 투석, ion exchange chromatography 등의 과정을 거쳐...2025.01.17
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대장균에서 재조합 단백질 생산 및 정제2025.01.131. 재조합 단백질 생산 대장균 BL21(DE3) 균주는 재조합 단백질 고발현에 널리 사용되며, lac 프로모터와 T7 프로모터를 이용하여 IPTG 유도 하에 단백질을 발현할 수 있다. 본 실험에서는 pET28a 벡터를 사용하여 His-tag 융합 단백질을 생산하고, Ni-NTA 친화성 크로마토그래피와 FPLC를 통해 단백질을 정제하는 방법을 익혔다. 2. 단백질 분석 SDS-PAGE를 통해 단백질 크기별 분리와 정제 과정을 확인하였고, Bradford assay로 단백질 농도를 정량하였다. 또한 DES와 OASS 효소 활성 측정을...2025.01.13
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연세대학교 생화학실험(1) 6주차 Peptide Mass Fingerprinting In-gel Digestion2025.05.041. Peptide Mass Fingerprinting (PMF) Peptide Mass Fingerprinting (PMF)은 단백질 동정을 위한 기술로, 단백질을 효소로 절단하여 생성된 펩타이드의 질량을 측정하고 데이터베이스와 비교하여 단백질을 식별하는 방법입니다. 이 기술은 SDS-PAGE를 통해 분리된 단백질 밴드에서 시작되며, 밴드를 절단하고 효소로 소화하여 생성된 펩타이드의 질량을 질량분석기로 측정합니다. 이렇게 얻은 펩타이드 질량 데이터를 데이터베이스와 비교하여 단백질을 동정하게 됩니다. 2. In-gel Digesti...2025.05.04
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의약품 합성 - 아스피린2025.05.011. 유기 합성 유기 합성이란, 원자나 원자단을 원하는 위치에 결합 및 연결시키는 과정으로 원자나 원자단 간의 상대적인 결합 외에도 3차원 구조까지 고려해야 하는 복잡한 과정이다. 유기 합성 과정에서 의도치 않게 생성되는 불순물은 합성의 효율을 떨어뜨림과 동시에, 합성의 결과로 생성된 화합물을 원활히 활용할 수 없게 만든다. 이러한 현상을 방지하기 위해, 합성 과정에 포함되는 반응의 효율을 증가시켜 불순물의 생성을 방지하거나, 불순물을 완벽히 제거하는 기술이 필요하다. 2. 정제 정제란, 어떤 물질로부터 함유된 불순물을 제거하여 물...2025.05.01
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