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NGS 분석 기기의 기술혁신전략: Illumina 사례 분석2025.11.131. Next Generation Sequencing (NGS) 기술 NGS는 적은 양의 샘플로 저비용으로 개인의 유전정보를 분석할 수 있는 차세대 염기서열 분석 기술입니다. DNA library와 cloning 과정을 제거하는 clonal amplification, 수십만 개의 clone을 동시에 이용하는 massively parallel, 모세관 전기영동을 제거한 base/color calling 등 3가지 개선 기술이 도입되었습니다. 이를 통해 인간의 genome 서열을 하루도 채 걸리지 않는 시간에 분석할 수 있게 되었으며,...2025.11.13
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유전자 다형성과 질병의 연관성2025.01.281. 유전자 다형성 유전자 다형성은 개체군 내에서 1% 이상의 개체가 가지고 있는 유전자 변이를 말한다. 이러한 변이는 대부분 돌연변이에 의해 발생하며 개인의 질병 감수성, 약물 반응, 신체적 특징 심지어 행동 특성까지 영향을 미칠 수 있다. 2. 유전자 다형성과 질병 간의 연관성 유전자 다형성은 질병 연구에 있어 매우 중요한 역할을 한다. 특정 유전자 다형성이 특정 질병에 대한 감수성을 높이거나 낮출 수 있기 때문이다. 예를 들어, BRCA1 및 BRCA2 유전자의 특정 다형성은 유방암과 난소암의 높은 발병률과 관련이 있다. 3....2025.01.28
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DNA 염기서열 분석과 진단의 적용2025.01.291. 생어 염기서열 분석(Sanger Sequencing) 생어 염기서열 분석은 1975년 영국의 생화학자 프레더릭 생어가 개발한 방법으로, DNA 복제 시 진행되는 DNA 중합효소 반응을 기반으로 하여 DNA 서열을 읽어내는 방식이다. 이후 자동화 기계가 개발되면서 인간유전체사업의 성공에 기여했고, 최근에는 차세대염기서열분석(NGS)이 개발되어 다양한 연구와 진단에 이용되고 있다. 2. 자동화 염기서열 분석 생어 염기서열 분석의 자동화를 위해 형광이 표지된 primer를 이용하여 각 튜브에서 반응이 끝난 산물을 하나로 합쳐 전기영...2025.01.29
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[유전학] DNA sequencing, vector의 제작, NGS2025.05.031. DNA sequencing DNA는 단백질을 암호화 하고있는 물질로 A,T,G,C라는 기본 단위로 이루어진다. 어떤 서열을 갖고 있는 지에 따라 결과적으로 생산되는 단백질이 달라지게 되는데 이 서열을 확인하는 것은 분자생물학에 있어서 큰 의미가 있다. DNA sequencing은 그 DNA 서열을 확인하는 방법이다. 과거에는 그 방법으로 sanger method를 사용했지만 현재는 더욱 빠르고 신속하게 원하는 DNA서열을 확인할 수 있는 방법인 NGS를 통해 염기서열을 확인한다. 2. Vector 제작 우리는 DNA 재조합 기...2025.05.03
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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대변 내 박테리아 DNA 추출 및 분석 실험2025.11.141. 장내 미생물총(Microbiota) 동물 및 식물에 존재하는 박테리아, 바이러스, 진균 등의 미생물총으로, 유전적 영향과 식이 차이에 따라 구성이 달라진다. 병원성 세균 억제, 장 상피세포 보호, 지방 축적 조절, 영양분 분해 및 흡수, 비타민 K 생산, 철분 흡수, 장 점막 면역 증강 등 인체 대사에 직접적인 영향을 미친다. 2. 이상증(Dysbiosis) 건강한 장내미생물 생태계에서 벗어난 상태로, 주요 미생물 수 감소와 유해균 증가를 특징으로 한다. 유해균의 독소는 DNA를 절단하고 장 상피세포를 손상시키며, 장 누수 증...2025.11.14
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AI와 DNA 시퀀싱2025.01.151. 유전자와 AI DNA 시퀀싱은 유전자의 염기서열을 알아내는 과정으로, 인간의 염색체에는 30억 쌍의 염기서열이 있어 엄청난 크기의 데이터를 다루게 된다. 이에 유전학에서는 막대한 양의 데이터를 처리하고자 AI를 사용하고 있으며, 대표적인 분야가 AI 시퀀싱이다. 2. DNA 시퀀싱 DNA 시퀀싱은 생화학적 방법으로 생명체의 모든 세포의 DNA 염기서열을 분석하는 기술이다. 과거에는 30억 개의 DNA 염기서열을 분석하는데 13년과 30억 달러가 소요되었으나, 현재는 기술 발달로 비용이 크게 감소했다. 다양한 DNA 시퀀싱 방법...2025.01.15
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암과 항암, NGS, 종양 유전자변이검사2025.01.181. 암 유전자 검사 암은 DNA 돌연변이로 인해 발생하는 대표적인 질환이며, 다양한 돌연변이가 암 발생에 관여한다. 유전자 검사를 통해 관련 질병의 예방, 진단, 치료계획을 수립할 수 있다. 유전자 검사 방식에는 FISH, PCR, RT-PCR, NGS 등이 있으며, 각각의 특징과 장단점이 있다. 2. 비소세포폐암 유전자 검사 비소세포폐암은 유전자 변이와 표적치료제 선택에 있어 유전자검사가 중요하다. EGFR, ALK, ROS1, KRAS 등의 유전자 변이가 관련되며, 이를 확인하기 위한 유전자검사가 권장된다. 3. 대장암 유전자...2025.01.18
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PCR과 제한효소 절단 실험 예비2025.11.131. PCR (중합효소연쇄반응) PCR은 DNA 샘플의 특정 영역을 선택적으로 증폭하는 분자생물학 기법입니다. 열변성, 프라이머 결합, DNA 중합효소에 의한 신장 단계를 반복하여 목표 DNA 서열을 기하급수적으로 증폭합니다. 이 기술은 유전자 진단, 법의학, 질병 검출 등 다양한 분야에서 필수적인 도구로 사용됩니다. 2. 제한효소 절단 (Restriction Enzyme Digestion) 제한효소는 특정 DNA 서열을 인식하여 절단하는 단백질입니다. 각 제한효소는 고유한 인식 부위를 가지며, 이를 이용하여 DNA를 특정 위치에서...2025.11.13
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PCR과 제한효소 절단 분석 결과2025.11.131. PCR (중합효소 연쇄반응) PCR은 DNA 샘플을 선택적으로 증폭하는 분자생물학 기법입니다. 열변성, 프라이머 결합, DNA 중합효소에 의한 신장 단계를 반복하여 특정 DNA 영역을 기하급수적으로 증폭합니다. 이 과정은 유전자 진단, 법의학, 질병 검출 등 다양한 분야에서 필수적인 도구로 사용되며, 정확한 온도 제어와 사이클 수 조절이 중요합니다. 2. 제한효소 절단 (Restriction Enzyme Digestion) 제한효소는 특정 DNA 서열을 인식하여 절단하는 단백질입니다. 제한효소 절단은 PCR 산물을 분석하기 위...2025.11.13
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