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AI 기반 효소 예측 기술 DeepEC 발표2025.01.031. AI 합성곱 신경망 합성곱 신경망(Convolutional Neural Network, CNN)은 시각적 영상을 분석하는 데 사용되는 다층의 피드-포워드적인 인공신경망의 한 종류입니다. CNN은 원본 이미지를 단순화, 변형, 샘플링하는 과정을 통해 효과적으로 이미지 특징을 추출할 수 있습니다. 2. 효소 예측 기술 'DeepEC' DeepEC은 4개의 EC 번호와 138만 8,606개의 단백질 서열 빅데이터를 학습한 딥러닝 기술입니다. 3개의 CNN을 주요 예측 기술로 사용하여 EC 번호를 예측하며, 예측에 실패할 경우 서열 ...2025.01.03
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인공지능 기반 효소 예측 기술 DeepEC2025.01.031. 열화학 반응과 반응엔탈피 열화학 반응은 열을 에너지 원천으로 하여 진행되는 반응으로, 발열 반응과 흡열 반응으로 구분된다. 반응엔탈피는 생성물질의 엔탈피에서 반응물질의 엔탈피를 뺀 값으로, 반응의 방향과 정도를 나타낸다. 2. 효소 효소는 세포의 생화학반응을 촉진하는 단백질 촉매로, 기질과 결합하여 효소-기질 복합체를 형성함으로써 화학 반응의 활성화 에너지를 낮추어 반응 속도를 증가시킨다. 효소는 열화학 반응에 관여하지만 반응 엔탈피를 유발하지는 않는다. 3. 합성곱 신경망 합성곱 신경망은 시각적 영상을 분석하는 데 사용되는 ...2025.01.03
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Michaelis-Menten 식의 기본 가정 및 풀이과정2025.11.121. Michaelis-Menten 식 효소 반응의 초기 속도를 설명하는 기본 식으로, ES complex 형성 단계를 거쳐 반응이 진행된다. 항정상태(Steady State) 가정 하에서 효소-기질 복합체의 형성과 분해 속도가 같다고 가정하여 유도된다. 이 식은 효소의 반응 속도가 기질 농도에 따라 어떻게 변하는지를 수학적으로 표현한다. 2. Steady State Assumption Michaelis-Menten 식 유도의 핵심 가정으로, ES complex의 농도가 시간에 따라 변하지 않는 상태를 의미한다. 이는 ES의 형성 ...2025.11.12
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미적분 보고서 세특 의학2025.01.151. 미적분을 통한 효소 반응 속도 이해 이 보고서에서는 미적분을 활용하여 효소 반응 속도에 대해 탐구하였습니다. 먼저 반응 속도에 영향을 미치는 요인들을 살펴보고, 평균 반응 속도와 순간 반응 속도의 개념을 정리하였습니다. 이를 바탕으로 미카엘리스-멘텐 식을 유도하는 과정을 자세히 설명하였습니다. 또한 미카엘리스-멘텐 식의 그래프와 라인위버-버크 방정식을 통해 효소 반응 속도에 대한 이해를 높였습니다. 1. 미적분을 통한 효소 반응 속도 이해 미적분은 효소 반응 속도 이해에 매우 유용한 수학적 도구입니다. 효소 반응 속도는 시간에...2025.01.15
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제한효소를 이용한 플라스미드 DNA 분석 및 전기영동2025.11.121. 제한효소(Restriction Enzyme) 제한효소는 DNA의 특정한 부위를 인식하여 phosphodiester bond를 절단하는 효소이다. 본 실험에서 사용된 HindIII 효소는 DNA상에서 T와 C 사이의 결합을 끊어 원형의 플라스미드 DNA를 선형 형태로 변환한다. 제한효소의 특이성에 따라 DNA의 특정 사이트를 찾아 절단하며, 이를 통해 제한효소 지도를 작성할 수 있다. 2. 아가로스 겔 전기영동(Agarose Gel Electrophoresis) DNA 조각을 분리하고 인식하는 가장 일반적인 방법으로, 간단하고 ...2025.11.12
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시그모이드 함수를 활용한 생명현상 분석2025.11.171. 로지스틱 방정식과 개체군 생장곡선 로지스틱 방정식은 생태학에서 개체군 성장을 모델링하는 미분방정식으로, 환경수용력에 수렴하는 S자형 생장곡선을 나타낸다. 초기에는 개체수가 천천히 증가하다가 가속되며, 환경저항으로 인해 한계수용력에서 증가율이 0이 된다. 이는 미분을 통해 변곡점을 찾아 그래프의 개형을 파악할 수 있으며, 생명과학1의 개체군 생장곡선 개념과 직접 연관된다. 2. 효소 반응속도와 로지스틱 곡선의 유사성 기질의 농도에 따른 효소의 반응속도 그래프는 로지스틱 곡선과 유사한 형태를 보인다. 일반효소는 기질 농도 증가에 ...2025.11.17
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화공생물공학 단위조작실험1 Enzyme kinetic assay : Horseradish Peroxidase2025.01.151. Michaelis–Menten 방정식 Michaelis–Menten kinetics는 생화학분야에서 가장 잘 알려진 효소와 반응속도론에 관한 모델 중 하나이다. 이 식을 Michaelis–Menten 식이라고 부르며, 단일 기질-효소 촉매반응의 속도식의 기본이 된다. 효소 반응속도론은 효소(E)-기질(S)의 복합체[ES] 형성단계의 가역반응과 ES 복합체의 비가역 해리단계의 2단계의 반응체계로부터 구할 수 있다. 빠른 평형 가정이나 유사 정상상태 가정을 통해 Michaelis-Menten 속도식을 유도할 수 있다. 2. 효소 ...2025.01.15
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Enzyme kinetics and enzyme immobilizations 결과보고서2025.04.261. 효소 반응 속도론 실험 목적은 반응 기질의 다양한 농도에서 lipase의 초기 반응속도를 측정하여 효소 반응의 촉매 효율을 결정하는 촉매 상수와 미카엘리스 상수를 이해하는 것입니다. 또한 고정화된 lipase의 초기 반응 속도를 측정하여 고정화 효소의 촉매 상수와 미카엘리스 상수를 결정하고, 자유 효소와 고정화 효소의 실험 결과를 비교함으로써 효소 고정화가 효소 반응 속도론에 미치는 영향을 이해하는 것입니다. 2. lipase 효소 lipase는 triglyceride의 ester 결합을 가수분해하여 글리세롤과 지방산을 생성하...2025.04.26
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불안정형 협심증 환자에서 관상동맥 중재술 중 Nicorandil의 임상 효과2025.01.221. 불안정형 협심증 불안정형 협심증은 심장 질환의 일종으로, 심장에 혈액 공급이 원활하지 않아 발생하는 증상입니다. 이 연구에서는 불안정형 협심증 환자를 대상으로 관상동맥 중재술 시 Nicorandil이라는 약물의 효과를 분석하였습니다. Nicorandil은 혈관을 확장시켜 심장에 더 많은 혈액을 공급할 수 있도록 돕는 약물입니다. 2. 관상동맥 중재술 관상동맥 중재술은 협착된 혈관을 확장시키는 시술입니다. 이 연구에서는 관상동맥 중재술을 받은 환자들을 대상으로 Nicorandil 투여 여부에 따른 심근 효소 수치, 주요 심장 사...2025.01.22
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PCR 프라이머 디자인 실습 가이드2025.11.111. PubMed 논문 검색 PubMed 데이터베이스에 접속하여 RAW 264.7 세포주 관련 프라이머 서열을 검색한다. 검색 시 RT-PCR을 제외하여 일반 PCR 프라이머를 찾는다. Real-time PCR의 경우 PCR 산물이 100~200bp로 작아 클로닝이 어렵기 때문이다. 대학교 이메일을 사용하면 유료 논문도 접근 가능하다. 2. Primer BLAST 분석 NCBI Primer BLAST 도구를 이용하여 PCR 산물의 크기를 예측한다. 논문에서 찾은 프라이머 서열을 입력하고, 생물종을 Homo sapiens에서 Mus ...2025.11.11
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