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DNA 염기서열 분석과 진단의 적용2025.01.291. 생어 염기서열 분석(Sanger Sequencing) 생어 염기서열 분석은 1975년 영국의 생화학자 프레더릭 생어가 개발한 방법으로, DNA 복제 시 진행되는 DNA 중합효소 반응을 기반으로 하여 DNA 서열을 읽어내는 방식이다. 이후 자동화 기계가 개발되면서 인간유전체사업의 성공에 기여했고, 최근에는 차세대염기서열분석(NGS)이 개발되어 다양한 연구와 진단에 이용되고 있다. 2. 자동화 염기서열 분석 생어 염기서열 분석의 자동화를 위해 형광이 표지된 primer를 이용하여 각 튜브에서 반응이 끝난 산물을 하나로 합쳐 전기영...2025.01.29
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개인 유전체 분석 시스템 (염기서열 분석)2025.04.261. 개인 유전체 분석 시스템 개인 유전체 분석 시스템은 개인의 유전 정보를 분석하여 건강 상태와 질병 위험을 파악하는 시스템입니다. 이 시스템은 유전체 해독 기술의 발전과 개인의 건강에 대한 관심 증가로 인해 최근 급격히 확산되고 있습니다. 유전체 분석 시스템은 전장 유전체 분석, 엑솜 분석, 유전자 패널 분석, 단일 염기서열(SNP) 분석 등 다양한 방식으로 이루어지며, 이를 통해 개인의 유전적 특성과 질병 위험을 파악할 수 있습니다. 2. 유전체 분석 시스템의 원리 유전체 분석 시스템의 핵심 원리는 DNA의 염기서열을 분석하는...2025.04.26
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레닌저 생화학 요약, 정리 (8장 뉴클레오타이드와 핵산)2025.05.071. 뉴클레오타이드와 핵산 이 장에서는 뉴클레오타이드와 핵산에 대해 설명합니다. 뉴클레오타이드는 DNA와 RNA의 기본 단위이며, 세포에서 화학 에너지를 운반하는 역할을 합니다. DNA는 이중나선 구조를 가지며 완벽하게 복제되는 특성이 있습니다. RNA는 가닥을 형성하지 않고 불안정한 특성이 있어 유전자로서의 역할을 하지 못합니다. DNA와 RNA는 유전 정보를 전달하는 과정인 복제, 전사, 번역에 관여합니다. 2. DNA 복제와 변이 DNA는 완벽하게 복제되지만 간혹 돌연변이가 발생할 수 있습니다. 이러한 돌연변이의 원인에는 탈아...2025.05.07
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레닌저 생화학 정리노트 Ch08. 뉴클레오타이드와 핵산2025.05.101. 뉴클레오타이드와 핵산 뉴클레오타이드는 DNA와 RNA의 구성요소로 유전정보를 포함하는 분자 저장고가 되며, ATP는 에너지 통화 및 중요한 조절신호로 세포 대사에서 중심적인 역할을 합니다. 뉴클레오타이드와 핵산은 특징적 염기와 오탄당을 가지고 있으며, 퓨린기와 피리미딘기로 구분됩니다. DNA는 이중나선 구조를 가지며 수소결합에 의해 상보적으로 결합하고, RNA는 단일가닥 구조로 다양한 3차원 구조를 가집니다. 뉴클레오타이드와 핵산은 비효소적 변환을 겪으며, 돌연변이, 탈아미노화, 탈퓨린화, 방사선 및 화학적 손상 등이 발생할 ...2025.05.10
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Gene Expression Analysis and Gene Set Enrichment Analysis2025.01.181. 전사체 데이터 유전 요인의 중요성이 부각됨에 따라 의료 분야에서는 사람들의 유전적 성향을 파악하여 질병을 예측, 예방하고, 개인의 유전정보를 기반으로 한 맞춤 의료 서비스에 관한 관심이 높아지고 있다. 맞춤 의료 서비스를 제공하기 위해서는 사람의 유전정보를 분석해야 하는데, 이 경우 전사체 (transcriptome: 세포나 조직에서 한순간 발현되는 전체 RNA의 모음을 의미한다. 이 RNA들을 이용하여 조직에 따라 발현되는 유전자들의 정보를 얻을 수 있다) 분석을 이용할 수 있다. 전사체 분석을 통해 정상 세포와 비정상 세포...2025.01.18
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PlasmidDNA Purification & Sanger Sequencing 보고서2025.01.211. Bacterial transformation 박테리아 transformation은 특정 DNA 조각을 박테리아의 유전체 내로 삽입하여 새로운 유전형질이 발현되도록 하는 방법입니다. 박테리아 plasmid는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site와 항생제 내성 유전자를 가지고 있어 외부 유전 물질을 자유롭게 삽입할 수 있습니다. 이를 통해 약 8kb의 긴 DNA 조각을 박테리아 plasmid에 삽입하여 복제할 수 있습니다. 2. Liquid LB culture 및 Colony inoculat...2025.01.21
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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Metagenomics 미생물 실험보고서2025.05.061. Metagenomics Metagenomics는 현재 약 99%의 미생물배양이 어렵다는 실험적인 한계를 보완하는 방법으로 직접환경샘플에서 DNA를 추출하여 Next-generationsequencing(NGS)를 진행하여 다양한 플랫폼을 이용하여 미생물의 군집구조(microbial community) 및 메타유전체(metagenome)를 분석하는데 이용되고 있다. 2. 토양 샘플 분석 이번 실험에서는 주변환경의 토양 sample을 채취하여 유전체 분석을 하는 방법을 이용했으며, 실험 과정은 토양 sample채취, 토양 samp...2025.05.06
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AI와 DNA 시퀀싱2025.01.151. 유전자와 AI DNA 시퀀싱은 유전자의 염기서열을 알아내는 과정으로, 인간의 염색체에는 30억 쌍의 염기서열이 있어 엄청난 크기의 데이터를 다루게 된다. 이에 유전학에서는 막대한 양의 데이터를 처리하고자 AI를 사용하고 있으며, 대표적인 분야가 AI 시퀀싱이다. 2. DNA 시퀀싱 DNA 시퀀싱은 생화학적 방법으로 생명체의 모든 세포의 DNA 염기서열을 분석하는 기술이다. 과거에는 30억 개의 DNA 염기서열을 분석하는데 13년과 30억 달러가 소요되었으나, 현재는 기술 발달로 비용이 크게 감소했다. 다양한 DNA 시퀀싱 방법...2025.01.15
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DNA 제한효소2025.01.151. 제한효소 제한효소는 세균이 박테리오파지의 공격을 받으면 생산하는 효소로 이중 나선의 DNA의 특정한 염기서열을 인식해 그 부분의 절단에 있어 촉매작용을 하는 효소이다. 대부분의 제한효소는 인식자리(recognition site) 또는 제한 자리(restriction site)라는 특정한 염기서열이 있는 자리에서 DNA를 절단한다. 제한효소는 회문이라는 양 사슬의 5'부터 3' 방향으로 똑같은 서열을 가진 DNA의 부위를 인식해 작용한다. 제한효소가 DNA를 절단하면 이중 가닥 중 한 가닥이 돌출된 형태를 띠는데 이를 점착 말단...2025.01.15
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