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아주대 생명과학실험 생물정보학 실습2025.01.131. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 분석하고 해석하기 위한 분야로, 데이터 세트가 크고 복잡한 경우에 특히 유용하다. 이 분야는 생물학, 화학, 물리학, 컴퓨터 과학, 컴퓨터 프로그래밍, 정보 공학, 수학 및 통계를 포함한 다양한 학문을 통합하여 생물학적 데이터를 분석하고 해석한다. 생물정보학의 주요 응용 분야에는 유전체학, 단백질체학, 이미지 및 신호 처리, 텍스트 마이닝, 생물학적 및 유전자 온톨로지 개발, 유전자 및 단백질 발현 및 조절 분석 등이 포함된다. 2. BLAST BLAST(Basic Local Align...2025.01.13
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생체 분자의 질량 분석: Tandem MS를 이용한 Substance P 펩타이드 분석2025.11.181. 질량 분석법(Mass Spectrometry) 질량 분석법은 시료의 분자들을 이온화시켜 질량 대 전하량(m/z)에 따라 분류하고 그 양을 측정하는 분석법이다. 매우 적은 양의 시료로도 분석이 가능하며, 고분별능 질량 분석법을 이용하면 불순물이 존재해도 정확한 분자식을 알 수 있다. 질량 분석기는 고진공 상태에서 분자를 이온화시켜 질량에 따라 분류하고, 질량 스펙트럼은 m/z를 x축으로, 이온의 상대적 양을 y축으로 한 그래프이다. 주요 이온화 방법으로는 전자 충돌 이온화(EI)와 자기 편향을 이용한 이온 분리가 있다. 2. 이...2025.11.18
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식품생화학 아미노산, 펩타이드, 단백질 요약2025.05.071. 아미노산과 펩타이드 아미노산은 단백질을 이루는 기본단위 물질로서, 20개 다른 종류의 아미노산이 결합하여 펩타이드를 이루고 단백질을 형성합니다. 아미노산은 극성 아미노산(중성, 산성, 염기성)과 비극성 아미노산으로 구분되며, 중성 pH 상태에서 양극성 이온 형태로 존재합니다. 펩타이드는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 구조이며, 일부 펩타이드는 고유의 생리활성을 가지고 있습니다. 대표적인 합성 펩타이드인 아스파탐은 감미료로 사용되고 있습니다. 2. 단백질 구조 단백질은 아미노산이 중합된 고분자 물질로, 1차 구조(아미노산 ...2025.05.07
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생물정보학 실험 및 유전자 서열 분석2025.11.161. 생물정보학 생명공학과 정보학의 합성어로 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받는 학문이다. 생물정보학은 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하여 서열을 탐구하고, DNA 및 단백질 서열 기반 생물 계통수를 그리는 데 사용된다. 이를 통해 생물 종 간의 진화적 관계와 유사성을 파악할 수 있다. 2. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 2개 이상의 핵산 서열이나 아미노산 서열의 유사성을 비교하는 도구이다. 뉴클레오타이드 서열이나 아미노산 서열이 데이터베이스에 저장된 서열과 일...2025.11.16
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아주대학교 A+ 생명과학실험 생물정보학실습2025.01.131. 생물정보학 생물정보학은 수학이나 통계학을 기초로 하여 컴퓨터를 이용해 생물학을 연구하는 학문을 의미한다. BLAST는 DNA 염기 서열과 아미노산 서열 등과 같이 생물학적 서열 정보를 비교하는 알고리즘이며, BLOSUM은 서열을 정렬할 때 쓰이는 치환 행렬로 두 아미노산 간의 유사성을 나타내는 매트릭스이다. 다중 서열 정렬(MSA)은 3개 이상의 DNA 염기 서열 또는 아미노산 서열을 한꺼번에 묶어서 정렬하는 방법으로, 대표적인 알고리즘은 ClustalW이다. 2. BLAST BLAST는 DNA 염기 서열과 아미노산 서열 등과...2025.01.13
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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[생물학실험1] 생물정보학2025.01.191. 생물정보학 생물정보학은 생물학과 컴퓨터를 이용한 정보학이 통합되어 발전된 학문으로, 수학이나 통계학을 기초로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 학문이다. 생물정보학으로 인해 유전 정보 등을 체계적으로 정리하고 발전시킬 수 있었으며, 컴퓨터를 이용한 실험 모델의 생산 등이 가능해졌다. 2. NCBI NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 미국 국립생물공학정보센터로, 생물 의학 및 게놈 정보에 대한 액세스를 제공함으로써 과학과 건강을 발전시키는 정보센터이다. 게놈 분석, 서...2025.01.19
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유전암호2025.05.081. 유전암호 유전암호는 단백질을 구성하는 각 아미노산을 지정하는 대응규칙을 가진 mRNA 암호를 말한다. DNA 유전정보가 mRNA로 전사된 후 단백질로 번역되는 과정에서 적용된다. mRNA의 뉴클레오타이드 3개가 하나의 코돈을 형성하여 아미노산과 연결되며, 이렇게 연결된 아미노산 서열이 폴리펩티드를 형성하여 단백질이 된다. 코돈은 mRNA 상의 3개의 염기서열로 구성되며, 총 64개의 암호화가 가능하다. 코돈에 따라 정해진 아미노산이 연결되며, 개시코돈은 보통 AUG이고 메티오닌이 연결되며, 종료코돈은 UAA, UAG, UGA ...2025.05.08
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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닌히드린 반응을 이용한 단백질 검정 실험2025.11.141. 아미노산 아미노산은 아미노기(-NH2)와 카르복시기(-COOH)를 가진 유기화합물로, 모든 단백질의 기본 구성단위입니다. 인체에서 단백질 생성에 사용되는 아미노산은 20종류이며, 알킬기(R)에 따라 종류가 결정됩니다. 아미노산은 양쪽성 물질로 산과 염기 모두로 작용할 수 있으며, 극성 여부와 산성/염기성에 따라 분류됩니다. 필수 아미노산은 체내에서 합성할 수 없어 식품으로 섭취해야 하며, 성인에게는 9가지 필수 아미노산이 있습니다. 2. 단백질 구조 단백질은 여러 아미노산이 펩티드 결합으로 연결된 고분자 유기물입니다. 단백질의...2025.11.14
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