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[A+] 연세대학교 생화학실험(2) 3주차 Plasmid and Plasmid DNA preparation2025.05.121. Plasmid and Plasmid DNA preparation 이 자료는 플라스미드와 플라스미드 DNA 준비에 대한 내용을 다루고 있습니다. 플라스미드는 세포 염색체와는 별도로 존재하는 자기 복제 DNA 분자로, 다양한 클로닝 사이트를 가지고 있습니다. 플라스미드 DNA 추출 과정에서는 세포벽 용해, 세포막 파괴, 염색체 DNA와 플라스미드 DNA 분리 등의 단계를 거치게 됩니다. 이를 통해 순수한 플라스미드 DNA를 얻을 수 있습니다. 1. Plasmid and Plasmid DNA preparation Plasmids a...2025.05.12
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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인천대학교 나노바이오실험(1) Genomic DNA prep & Gel Electrophoresis2025.01.141. Genomic DNA Genomic DNA는 염색체 DNA로, Plasmid DNA와 같은 Extra-chromosomal DNA와 대조되는 개념이다. 대부분의 생물은 모든 세포에서 같은 Genomic DNA를 갖지만, 특정 gene의 발현으로 cell type과 function이 달라진다. 어떤 organism의 genomic DNA인지에 따라 바이러스, 박테리아, 진핵생물 등의 특성을 지닌다. 2. DNA 추출 방법 DNA 추출은 Lysis, Precipitation, Purification 3단계로 이루어진다. Lysis...2025.01.14
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DNA 분리2025.01.161. DNA 구조 DNA는 인산, 당, 염기가 1:1:1의 비율로 결합한 뉴클레오타이드의 결합체이며, 2개의 폴리뉴클레오타이드가 이중 나선 구조를 이루고 있다. DNA 가닥은 인산이 가장 바깥쪽에 위치하고 있으며, 4가지 질소 염기(A, T, G, C)가 수소결합으로 쌍을 이루고 있다. 2. 중심원리 DNA를 주형으로 하여 RNA를 합성하는 전사 과정과, 전사된 mRNA가 단백질로 번역되는 과정으로 구성된다. 원핵세포의 경우 전사와 번역이 동시에 일어날 수 있다. 3. DNA 추출 원리 세포 및 조직을 파괴하고 단백질을 변성시킨 후...2025.01.16
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TECAN을 이용한 DNA quality check와 전기영동을 통한 대장균의 병원성 유형 확인2025.01.121. DNA 추출 및 정제 세포로부터 DNA를 분리하기 위해서는 먼저 세포 내 DNA가 세포 밖으로 유출될 수 있도록 세포벽 및 세포막을 분해시켜야 한다. DNA 추출은 크게 세 단계로 이루어지며, sample의 세포막을 제거하는 단계인 Lysis, DNA 구조를 제외한 불순물을 제거하는 단계인 Washing, 불순물이 필터링된 DNA 샘플만을 tube에서 용출해내는 단계인 Elution이 있다. 2. DNA quality check 추출한 DNA는 DNA quality check를 해주고, Nucleic acid quantific...2025.01.12
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아주대 생물학실험1 결과보고서 [14주차 Plasmid DNA 추출]2025.01.031. 원핵세포와 진핵세포의 유전자 위치 및 특징 차이 원핵세포의 경우 유전체가 한 분자의 원형 DNA로 구성되며, 세포질에 위치한다. 반면 진핵세포의 경우 선형 구조의 DNA가 히스톤 단백질과 결합해 염색체를 구성하고 핵 안에 위치한다. 원핵세포에는 막으로 둘러싸인 세포 소기관이 없으며 세포질에 원형의 작은 DNA인 플라스미드를 갖기도 한다. 진핵세포는 복잡한 막 구조의 세포 소기관을 가지며 플라스미드를 거의 갖지 않는다. 2. 플라스미드 DNA의 물리적 형태 플라스미드 DNA는 Supercoiled DNA, Open-circula...2025.01.03
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생화학실험 DNA추출, PCR, Gel전기영동2025.05.061. Genomic DNA Genomic DNA는 핵 내에 존재하는 유기체 내의 chromosomal DNA이며 플라스미드와 같은 염색체 외 DNA와 대조적으로 염색체 DNA이다. A, T, G, C의 염기쌍들이 유전정보를 저장하며 사람의 경우에는 32억 개 이상의 염기쌍을 갖는다. 대부분의 유기체는 모든 세포에서 동일한 유전체 DNA를 가지고 있다. 2. B16F10 cell B16F10 세포는 인간 피부암의 모델로 연구에 사용되는 종양 세포주이다. B16 세포는 전이 및 고체 종양 형성 연구에 유용한 모델이며 전이 연구를 위한 ...2025.05.06
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아주대 생명과학실험 Plasmid DNA 추출2025.01.131. 플라스미드 DNA 플라스미드 DNA는 원핵세포의 세포질 및 진핵생물의 세포 소기관에서 발견되는 작고 원형의 이중 가닥 DNA 분자이다. 이 DNA 조각들은 자율적으로 복제할 수 있으며, 세포의 염색체 DNA와는 독립적으로 존재한다. 플라스미드는 보통 추가적인 유전 정보를 포함하고 있으며, 특정 환경 조건에서 숙주 세포에 유익할 수 있는 기능들을 부여한다. 2. 제한효소 제한효소(EcoRI)는 플라스미드 DNA를 실험실에서 조작하기 위한 주요 도구이다. 이 효소는 특정 짧은 DNA 서열을 인식하고 절단할 수 있는 능력이 있어, ...2025.01.13
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플라스미드 미니 준비 발표2025.01.061. 플라스미드 플라스미드는 박테리아가 가진 염색체 이외의 DNA 분자입니다. 1952년 미국의 유전학자 J. 레더버그가 최초로 플라스미드를 발견했으며, 이는 박테리아가 독자적으로 증식할 수 있는 DNA 분자라는 의미로 명명되었습니다. 플라스미드는 유전공학에서 중요한 역할을 하며, 플라스미드 준비는 플라스미드 DNA를 추출하고 정제하는 과정입니다. 2. 플라스미드 미니 준비 플라스미드 미니 준비는 박테리아로부터 소량의 플라스미드 DNA를 추출하고 정제하는 방법입니다. 이 방법은 많은 후보를 빠른 시간 내에 분석할 수 있게 해줍니다....2025.01.06
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Metagenomics 미생물 실험보고서2025.05.061. Metagenomics Metagenomics는 현재 약 99%의 미생물배양이 어렵다는 실험적인 한계를 보완하는 방법으로 직접환경샘플에서 DNA를 추출하여 Next-generationsequencing(NGS)를 진행하여 다양한 플랫폼을 이용하여 미생물의 군집구조(microbial community) 및 메타유전체(metagenome)를 분석하는데 이용되고 있다. 2. 토양 샘플 분석 이번 실험에서는 주변환경의 토양 sample을 채취하여 유전체 분석을 하는 방법을 이용했으며, 실험 과정은 토양 sample채취, 토양 samp...2025.05.06
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