BLAST

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최초 생성일 2024.12.04
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"BLAST"에 대한 내용입니다.

목차

1. 미생물 동정 실험 - sequencing & BLAST
1.1. 실험 목적
1.2. 실험 재료
1.3. 실험 방법
1.3.1. DNA sequencing
1.3.2. BLAST를 이용한 균 동정
1.4. 실험 결과
1.4.1. 균 동정 결과
1.5. 토의
1.5.1. DNA sequencing의 중요성
1.5.2. BLAST를 이용한 균 동정 방법
1.5.3. BLAST 결과 해석의 핵심 요소

2. 참고 문헌

본문내용

1. 미생물 동정 실험 - sequencing & BLAST
1.1. 실험 목적

이번 실험의 목적은 5개의 DNA 및 단백질 서열을 BLAST를 이용해 동정하여 어떤 코로나 바이러스인지 파악하고, BLOSUM 분석을 활용하여 5개의 바이러스 중 Human-SARS-CoV-2와 가장 유사한 아미노산 서열을 가진 바이러스가 무엇인지 관찰하는 것이다.


1.2. 실험 재료

실험 재료는 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool), 동정하려는 균의 염기 서열이다.

BLAST는 뉴클레오타이드 데이터베이스(nucleotide database)와 단백질 데이터베이스(protein database)의 신속한 검색 방법을 제공하는 NCBI의 도구이다. 이를 통해 미지의 뉴클레오타이드 서열 또는 단백질 서열을 데이터베이스와 비교하여 유사한 서열을 찾아 균을 동정할 수 있다.

동정하려는 균의 염기 서열은 DNA sequencing 기술을 통해 결정된다. DNA sequencing은 DNA에서 뉴클레오타이드의 순서인 염기서열을 결정하는 과정으로, 이를 통해 미지의 균을 동정하고 분류할 수 있다.


1.3. 실험 방법
1.3.1. DNA sequencing

DNA sequencing은 DNA에서 뉴클레오타이드의 순서인 염기서열을 결정하는 과정이다. DNA sequencing에는 아데닌, 구아닌, 사이토신, 티민의 4가지 염기의 순서를 결정하는 데 사용되는 모든 방법 및 기술이 포함된다. DNA 염기서열에 대한 지식은 기본적인 생물학적 연구와 의학 진단, 생명공학, 법의생물학, 바이러스학, 계통분류학과 같은 수많은 응용 분야에서 필수적이다. 정상적인 DNA 염기서열과 돌연변이가 일어난 DNA 염기서열을 비교하면 다양한 질병을 진단하고, 항체 레퍼토리를 특정할 수 있으며, 환자 치료를 안내하는 데 사용할 수 있다. 또한 DNA를 신속하게 시퀀...


참고 자료

위키피디아, BLOSUM
https://ko.wikipedia.org/wiki/BLOSUM
위키피디아, SARS-CoV
https://ko.wikipedia.org/wiki/SARS-CoV
위키피디아, SARS-CoV-2
https://ko.wikipedia.org/wiki/SARS-CoV-2

유전공학의 이해/ 남상욱 외 2인/ 라이프 사이언스/ p.224~227
https://ko.wikipedia.org/wiki/DNA_%EC%8B%9C%ED%80%80%EC%8B%B1
http://www.bio.davidson.edu/courses/molbio/molstudents/01licohen/sequencing.html

태그

#DNA sequencing #BLAST #코로나 바이러스 #SARS-CoV-2 #MERS-CoV #Bat SARS-like coronavirus #아미노산 서열 #BLOSUM 분석 #균 동정 #생물학 응용 분야

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