총 25개
-
NCBI의 유전자 서열 분석 및 단백질 삼차원 구조 모델링2025.01.231. NCBI 데이터베이스 NCBI에서 제공하는 다양한 데이터베이스(Genome, BioProject, BioSystems 등)에 대해 설명하고, 이를 통해 유전자 정보와 서열을 분석할 수 있음을 설명하였다. 2. 유전자 돌연변이 유전자 돌연변이의 개념과 종류(염기 치환, 결실, 삽입, 중복, 역위, 반복 확장 등)에 대해 설명하였다. 3. SOD1 유전자 SOD1 유전자의 기능, 발현, 관련 질병 등에 대해 자세히 설명하였다. 4. 서열 정렬 BLAST와 MSA 기법을 사용하여 SOD1 단백질 서열을 다른 생물종과 비교 분석하고,...2025.01.23
-
생화학 PyMol 사용 단백질 구조 관찰 보고서2025.04.301. Myoglobin (PDB ID: 1MBN) Myoglobin은 근육 세포에 존재하는 단백질로, 산소 운반 및 저장 기능을 합니다. 이 보고서에서는 PyMol 프로그램을 사용하여 Myoglobin의 3차원 구조를 다양한 그래픽 표현 방식으로 관찰하였습니다. 스틱, 카툰, 구 모델 등을 통해 Myoglobin의 전반적인 구조와 Heme 그룹 및 His93 잔기와의 상호작용을 확인할 수 있었습니다. 1. Myoglobin (PDB ID: 1MBN) Myoglobin is a small, globular protein found i...2025.04.30
-
생명과학분야에서의 인공지능 활용 - Alphafold를 중심으로2025.05.081. 단백질 구조 예측의 중요성 단백질은 여러 개의 아미노산이 서열을 이루고 결합한 것이다. 단백질의 구조를 알아내는 것이 현대 생물학에서 매우 중요하다. 단백질의 구조에 따라 기능과 작동 방식이 달라지기 때문이다. 코로나 바이러스 연구와 암 치료를 위한 표적항암제 개발에서 단백질 구조 정보가 중요한 역할을 한다. 2. 단백질 구조 예측의 어려움 단백질은 마구잡이로 접혀 3차원의 형태로 존재하기 때문에 그 구조를 알기가 어려웠다. 기존에는 X선을 이용한 단백질 결정 분석 방식이 유일한 방법이었지만, 비용과 시간이 많이 들어 적절한 ...2025.05.08
-
분자의 모양과 결정 구조 분석2025.11.121. 분자의 모양 분자의 기하학적 구조와 형태를 분석하는 분야로, 원자들 간의 결합각도와 공간적 배치를 연구합니다. 분자의 모양은 화학적 성질과 반응성을 결정하는 중요한 요소이며, VSEPR 이론 등을 통해 예측할 수 있습니다. 2. 결정 구조 고체 물질의 원자나 분자가 규칙적으로 배열된 3차원 구조를 의미합니다. 결정 구조는 X선 회절, 전자 현미경 등의 기법으로 분석되며, 물질의 물리적 성질과 밀접한 관련이 있습니다. 3. 분자 구조 분석 분자의 원자 배치, 결합 길이, 결합각 등을 측정하고 분석하는 과정입니다. 분광학, 회절 ...2025.11.12
-
아주대학교 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서2025.04.261. 생물정보학 생물정보학(bioinformatics)은 생물학과 컴퓨터의 정보학이 융합되어 발전된 학문으로, 생물의학을 포함한 다양한 과학 연구 분야를 지원하기 위해 정보 저장, 배포 및 분석을 위한 기술과 생물 데이터를 연결하는 하이브리드 과학이다. 본 실험에서는 생물정보학 Tool의 사용법을 익히고, 미지 유전자를 데이터베이스에 대조하여 서열을 탐구하며, 단백질 서열의 유사성을 비교해 보았다. 2. 핵산(nucleic acid) 핵산은 분해되어 인산, 당 및 유기 염기의 혼합물(퓨린 및 피리미딘)을 생성할 수 있는 자연 발생 ...2025.04.26
-
[물리화학실험A+]Computational chemistry(계산화학) 결과보고서2025.01.171. Butane의 conformation 이번 실험은 Avogadro라는 양자역학 계산프로그램을 사용하여 butane의 최적화된 구조를 구하고 butane의 conformation에 따른 다양한 분자 모형을 생성하고 에너지 및 안정성을 비교해 볼 수 있는 실험이다. Butane의 conformation은 이면각이 0°에서 Fully eclipsed 형태, 이면각이 60°에서 staggered의 gauche 형태, 이면각이 120°에서 eclipsed 형태, 이면각이 180°에서 staggered의 anti 형태를 가질 수 있다. ...2025.01.17
-
서울대학교 물리분석실험 FRET(2024)2025.01.231. FRET(Forster resonance energy transfer) FRET은 두 dye 사이의 non-radiative energy transfer로, donor dye가 들뜬 상태가 되면 acceptor dye에게 에너지를 전달한 뒤 바닥 상태로 돌아가는 현상이다. FRET efficiency는 실험적으로 측정되며 이로부터 두 색소 사이의 거리를 계산할 수 있다. 반대로, TCSPC(Time correlated single photon counting)를 이용해 형광 lifetime을 측정하면 이를 이용해 FRET ef...2025.01.23
-
매듭이론2025.01.151. 매듭 이론 수학에서 매듭을 학문적으로 시작하게 된 계기는 '분자의 화학적 성질이 이를 구성하는 원자들이 어떻게 꼬여서 매듭을 이루고 있는가에 달려 있다'는 켈빈(Kevin)의 볼텍스(vortex)이론으로부터 기인하였습니다. 수학에서의 매듭 이론은 간단히 말하면 매듭의 교차점의 수에 따라 매듭을 분류하는 것입니다. 그런데 교차점의 수가 9개인 매듭은 수십 개 정도이지만 교차점의 수가 10개인 매듭은 수백 개가 되기 때문에 단순한 방법으로 이들을 분류하는 것은 불가능합니다. 매듭을 분류하기 위해서 가장 먼저 해야 할 일은 두 매듭...2025.01.15
-
변환 분석(Transform Analysis)에 대한 설명2025.01.181. 변환 분석 변환 분석은 논리 개념 데이터 흐름을 물리 개념 설계 구조도로 변환하는 기술입니다. 변환 분석을 통해 설계 구조도를 작성하는 과정은 데이터 흐름 작성, 중앙 변환 영역 추출, 구조도 초안 작성(1차 구조도 지침), 구조도 개선(완전 구조도) 등 4단계로 구성됩니다. 중심변환영역 추출처리에는 논리데이터 흐름에 따른 방법이 2가지가 있으며, 데이터 흐름차트에 신뢰성 있는 중앙처리가 있는 경우에 이용하는 방법과 데이터 흐름차트를 입력영역, 변환영역, 출력영역의 3가지로 분할하는 방법이 있습니다. 2. 폭포수 모델 폭포수 ...2025.01.18
-
Enzyme Activity- Colorimetric of Catalase2025.01.131. 효소 효소(enzyme)란 생체 내의 화학반응을 매개하는 단백질 촉매이다. 효소와 결합하는 특이적 반응물을 기질(substrate)이라고 하고 기질과 반응하여 활성화 에너지를 낮춰 반응을 촉진 시킨다. 기질의 입체구조와 효소의 활성부위가 맞아야 결합하여 반응이 일어나고 이를 기질특이성을 가졌다고 한다. 효소는 결국 단백질이므로 3차구조에 중요한 온도, pH 등 환경 조선이 활성 정도에 영향을 미친다. 촉매 작용에는 총 네가지 정도의 방법이 있다. 2. 카탈레이스 카탈레이스는 O2 대사 동안 생성된 과산화수소에 의한 산화적 손상...2025.01.13
1 / 3
