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DNA 염기서열 분석과 진단의 적용2025.01.291. 생어 염기서열 분석(Sanger Sequencing) 생어 염기서열 분석은 1975년 영국의 생화학자 프레더릭 생어가 개발한 방법으로, DNA 복제 시 진행되는 DNA 중합효소 반응을 기반으로 하여 DNA 서열을 읽어내는 방식이다. 이후 자동화 기계가 개발되면서 인간유전체사업의 성공에 기여했고, 최근에는 차세대염기서열분석(NGS)이 개발되어 다양한 연구와 진단에 이용되고 있다. 2. 자동화 염기서열 분석 생어 염기서열 분석의 자동화를 위해 형광이 표지된 primer를 이용하여 각 튜브에서 반응이 끝난 산물을 하나로 합쳐 전기영...2025.01.29
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레닌저 생화학 요약, 정리 (8장 뉴클레오타이드와 핵산)2025.05.071. 뉴클레오타이드와 핵산 이 장에서는 뉴클레오타이드와 핵산에 대해 설명합니다. 뉴클레오타이드는 DNA와 RNA의 기본 단위이며, 세포에서 화학 에너지를 운반하는 역할을 합니다. DNA는 이중나선 구조를 가지며 완벽하게 복제되는 특성이 있습니다. RNA는 가닥을 형성하지 않고 불안정한 특성이 있어 유전자로서의 역할을 하지 못합니다. DNA와 RNA는 유전 정보를 전달하는 과정인 복제, 전사, 번역에 관여합니다. 2. DNA 복제와 변이 DNA는 완벽하게 복제되지만 간혹 돌연변이가 발생할 수 있습니다. 이러한 돌연변이의 원인에는 탈아...2025.05.07
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분자생물학 실험 (A+)Agarose gel eelectrophoresis 결과보고서2025.01.041. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis는 DNA 분자를 분리하고 분석하는 기술입니다. 이 실험에서는 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 전기장을 가해 DNA 조각들을 크기에 따라 분리합니다. 이를 통해 DNA 조각의 크기와 양을 확인할 수 있습니다. 이 기술은 유전자 클로닝, DNA 서열 분석, 유전자 발현 분석 등 다양한 분자생물학 실험에 사용됩니다. 2. DNA 분리 및 분석 이 실험에서는 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 전기장을 가해 DNA 조각들을 크기...2025.01.04
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DNA 제한효소 실험 결과 분석2025.11.161. 제한효소(Restriction Enzyme) DNA 제한효소는 특정 염기서열을 인식하여 DNA를 절단하는 효소이다. 실험에서 사용된 EcoRI는 5'-GAATTC-3' 서열을, HindIII는 5'-AAGCTT-3' 서열을 인식하여 각각 절단한다. 이들 효소는 분자생물학 연구에서 DNA 조작의 기본 도구로 사용되며, 특정 위치에서만 DNA를 절단하는 특이성을 가진다. 2. 전기영동(Electrophoresis) 전기영동은 DNA 절편을 크기별로 분리하는 기술이다. 실험에서는 아가로스 겔을 사용하여 제한효소로 절단된 DNA 절편...2025.11.16
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레닌저 생화학 정리노트 Ch08. 뉴클레오타이드와 핵산2025.05.101. 뉴클레오타이드와 핵산 뉴클레오타이드는 DNA와 RNA의 구성요소로 유전정보를 포함하는 분자 저장고가 되며, ATP는 에너지 통화 및 중요한 조절신호로 세포 대사에서 중심적인 역할을 합니다. 뉴클레오타이드와 핵산은 특징적 염기와 오탄당을 가지고 있으며, 퓨린기와 피리미딘기로 구분됩니다. DNA는 이중나선 구조를 가지며 수소결합에 의해 상보적으로 결합하고, RNA는 단일가닥 구조로 다양한 3차원 구조를 가집니다. 뉴클레오타이드와 핵산은 비효소적 변환을 겪으며, 돌연변이, 탈아미노화, 탈퓨린화, 방사선 및 화학적 손상 등이 발생할 ...2025.05.10
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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대변 내 박테리아 DNA 추출 및 분석 실험2025.11.141. 장내 미생물총(Microbiota) 동물 및 식물에 존재하는 박테리아, 바이러스, 진균 등의 미생물총으로, 유전적 영향과 식이 차이에 따라 구성이 달라진다. 병원성 세균 억제, 장 상피세포 보호, 지방 축적 조절, 영양분 분해 및 흡수, 비타민 K 생산, 철분 흡수, 장 점막 면역 증강 등 인체 대사에 직접적인 영향을 미친다. 2. 이상증(Dysbiosis) 건강한 장내미생물 생태계에서 벗어난 상태로, 주요 미생물 수 감소와 유해균 증가를 특징으로 한다. 유해균의 독소는 DNA를 절단하고 장 상피세포를 손상시키며, 장 누수 증...2025.11.14
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Metagenomics 미생물 실험보고서2025.05.061. Metagenomics Metagenomics는 현재 약 99%의 미생물배양이 어렵다는 실험적인 한계를 보완하는 방법으로 직접환경샘플에서 DNA를 추출하여 Next-generationsequencing(NGS)를 진행하여 다양한 플랫폼을 이용하여 미생물의 군집구조(microbial community) 및 메타유전체(metagenome)를 분석하는데 이용되고 있다. 2. 토양 샘플 분석 이번 실험에서는 주변환경의 토양 sample을 채취하여 유전체 분석을 하는 방법을 이용했으며, 실험 과정은 토양 sample채취, 토양 samp...2025.05.06
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NGS 분석 기기의 기술혁신전략: Illumina 사례 분석2025.11.131. Next Generation Sequencing (NGS) 기술 NGS는 적은 양의 샘플로 저비용으로 개인의 유전정보를 분석할 수 있는 차세대 염기서열 분석 기술입니다. DNA library와 cloning 과정을 제거하는 clonal amplification, 수십만 개의 clone을 동시에 이용하는 massively parallel, 모세관 전기영동을 제거한 base/color calling 등 3가지 개선 기술이 도입되었습니다. 이를 통해 인간의 genome 서열을 하루도 채 걸리지 않는 시간에 분석할 수 있게 되었으며,...2025.11.13
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유전자와 유전자 활성 연구를 위한 분자도구2025.01.181. 서던블롯 서던블롯은 특정 DNA 절편을 동정하는 데 사용되는 기술입니다. 이 방법은 genomic DNA를 제한효소로 자른 후 아가로스 겔 전기영동을 통해 크기별로 분리합니다. 그리고 DNA를 변성시켜 nitrocellulose 또는 nylon 멤브레인으로 이동시킵니다. 이렇게 이동된 DNA는 방사선 동위원소나 비방사선 물질로 표지된 DNA 또는 RNA 탐침과 하이브리다이제이션되어 자기방사법 등을 통해 검출됩니다. 이 기술은 genomic DNA뿐만 아니라 plasmid, cosmid, bacteriophage 등의 분석에도 ...2025.01.18
